221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2666 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 
145 aa  121  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
143 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
177 aa  95.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
147 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
145 aa  90.1  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2398  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 
177 aa  84.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10425  normal  0.260078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5523  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  40.44 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00475491  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21040  ADP-ribose pyrophosphatase  39.34 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  35 
 
 
145 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1297  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  35.14 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
137 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  33.33 
 
 
149 aa  61.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
133 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
133 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
133 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
148 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  37.38 
 
 
132 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  37.38 
 
 
132 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  36.05 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09350  dihydrofolate reductase  32.26 
 
 
337 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.32591  normal  0.990964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
132 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
334 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  35.29 
 
 
136 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
138 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
138 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
291 aa  54.7  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  37.72 
 
 
138 aa  54.7  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
138 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
140 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  37.21 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
134 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0028  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
155 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  35.63 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  35.63 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  35.63 
 
 
138 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  34.51 
 
 
134 aa  51.6  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  36.73 
 
 
136 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
154 aa  51.2  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  37.17 
 
 
347 aa  51.2  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  29.84 
 
 
137 aa  51.2  0.000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  38.46 
 
 
313 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  32.79 
 
 
134 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  36.45 
 
 
132 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3844  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  33.93 
 
 
459 aa  50.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  32.99 
 
 
135 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  33.67 
 
 
142 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  33.33 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
133 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  33.67 
 
 
137 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
138 aa  48.9  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
135 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  25.78 
 
 
132 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  31.82 
 
 
152 aa  48.5  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  34.02 
 
 
128 aa  48.5  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
136 aa  48.1  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
140 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
132 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
135 aa  48.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  32.74 
 
 
132 aa  48.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  35.24 
 
 
142 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  32.77 
 
 
337 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2550  hypothetical protein  25.76 
 
 
203 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.159383  normal  0.669028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  38.18 
 
 
316 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
129 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  50 
 
 
184 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  39.18 
 
 
315 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3288  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.549331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1569  hypothetical protein  30.88 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  31.93 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4870  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  37.84 
 
 
185 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0257995  normal  0.425035 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  36.89 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  35.24 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  31.93 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  31.93 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33 
 
 
140 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0241  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
157 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.270437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>