More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2653 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  100 
 
 		 275 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  46.61 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  51.41 
 
 		 254 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  52.57 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  47.41 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  54.2 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  48.18 
 
 		 254 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.19 
 
 		 271 aa  234  9e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5388  ABC transporter related  47.81 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133322  normal  0.359169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  48.59 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  50.21 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  48.19 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.19 
 
 		 262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  51.23 
 
 		 266 aa  225  7e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  47.15 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  42.06 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  47.39 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  41.34 
 
 		 279 aa  222  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 263 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  42.29 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  41.83 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  42.29 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  38.26 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  45.49 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  45.49 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  48.18 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  39.54 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  39.54 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  54.66 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  39.54 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  41.9 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  40.71 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  46.46 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  46.46 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  46.06 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  42.86 
 
 		 262 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  37.69 
 
 		 307 aa  215  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 		 265 aa  215  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.11 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  46.34 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  40.32 
 
 		 293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  41.41 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  49.21 
 
 		 339 aa  211  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  41.92 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  40.4 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  43.48 
 
 		 324 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 251 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  38.49 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  46.61 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  44.86 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.38 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  45.24 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  37.5 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.62 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.51 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.62 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  48.72 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.28 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.62 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  41.42 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  44.88 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  43.18 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  43.18 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4671  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  43.18 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  39.84 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  42.8 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  44.44 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0965  ABC transporter related  40.07 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  42.23 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  49.17 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  42.8 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  44.58 
 
 		 262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  43.65 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  45.53 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  41.37 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  44.09 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  46.97 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.6 
 
 		 266 aa  194  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  42.46 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  33.94 
 
 		 418 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  48.29 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1360  ABC transporter related  45.78 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  43.63 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  41.77 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  43.25 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  42.8 
 
 		 414 aa  192  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  44.09 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>