54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2575 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  100 
 
 
261 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  50 
 
 
330 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  47.33 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  48.24 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  47.71 
 
 
261 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  47.29 
 
 
323 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  45.77 
 
 
397 aa  228  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  46.95 
 
 
259 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  45.25 
 
 
324 aa  217  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  46.18 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  44.05 
 
 
317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  44.75 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  44.05 
 
 
316 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  45.8 
 
 
259 aa  210  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  45.82 
 
 
376 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  53.25 
 
 
259 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  44.27 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  42.75 
 
 
256 aa  191  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  39.08 
 
 
254 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  37.64 
 
 
270 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  35.02 
 
 
254 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  32.63 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  34.17 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  32.5 
 
 
305 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  31.15 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  29.75 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  32.7 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  31.84 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  30.96 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  32.24 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  34.09 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  32.9 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  34.09 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  32.27 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  32.9 
 
 
251 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  31.84 
 
 
251 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  31.84 
 
 
251 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  33.64 
 
 
246 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  30.71 
 
 
248 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  32.2 
 
 
241 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  31.02 
 
 
251 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  32.66 
 
 
252 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  32.66 
 
 
252 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  30.96 
 
 
250 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  30.67 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  31.02 
 
 
318 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  28.51 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  27.68 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  28.18 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  26.32 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  32.62 
 
 
133 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  26.95 
 
 
132 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0764  hypothetical protein  32 
 
 
228 aa  52  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>