More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2544 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 300 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  38.76 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  35.03 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  33.65 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 327 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 319 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  34.4 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  33.6 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  36.72 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  36.44 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  32.44 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 314 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 301 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  34.07 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  35 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  36.5 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  32 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 308 aa  95.5  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  34.17 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  31.4 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  32.66 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  34.2 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  35.48 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 314 aa  92.4  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  30.54 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  30.96 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  31.4 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2695  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 320 aa  85.9  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  33.71 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0420  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  27.2 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6361  nitrogen assimilation transcriptional regulator  30.52 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  28.71 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3833  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.06 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  26.73 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0989  LysR, substrate-binding  27.57 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.745768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>