17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2518 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2518  Nucleotidyltransferase, predicted  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0207586  hitchhiker  0.00121784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1072  hypothetical protein  71.26 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.042495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1902  hypothetical protein  49.44 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0481  Nucleotidyltransferase, predicted  44.94 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3808  hypothetical protein  46.37 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6191  hypothetical protein  33.59 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  33.48 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  32.34 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0028  uncharacterized protein, YcgL-like protein  32.06 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  29.31 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  31.06 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0390  hypothetical protein  35.96 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.525134  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  27.85 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  28.21 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  26.37 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  29.36 
 
 		 356 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  24.52 
 
 		 364 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>