200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2440 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2440  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 424 aa  789    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4777  major facilitator superfamily MFS_1  66 
 
 		 414 aa  418  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  33.09 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26 
 
 		 420 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26 
 
 		 420 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.23 
 
 		 420 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.74 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.76 
 
 		 420 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  25.19 
 
 		 420 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 455 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 432 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  32.15 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  22.26 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  21.9 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0867  putative membrane transport protein  36.87 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 436 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  20.64 
 
 		 393 aa  67  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  28.37 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  28.37 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  28.16 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  20.43 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  26.59 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1664  permease; tetracycline resistance determinant  28.35 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.83 
 
 		 1833 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  29.89 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  25.34 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 450 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.12 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  21.27 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  20.8 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  24.29 
 
 		 397 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  25.8 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.86 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  21.28 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 438 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 422 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  22.86 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  23.62 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  22.86 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 491 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  22.69 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.95 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  22.63 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  24.09 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  22.63 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3535  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00357362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  22.95 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  23.28 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2297  putative membrane transport protein  41.43 
 
 		 163 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  22.32 
 
 		 422 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  21.19 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  22.05 
 
 		 362 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0918  major facilitator superfamily permease  22.22 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  20.37 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.14 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.11 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  22.38 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>