More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2407 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
275 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  74.91 
 
 
275 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  75.82 
 
 
275 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  58.76 
 
 
273 aa  344  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  58.18 
 
 
273 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  58.18 
 
 
273 aa  341  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  57.09 
 
 
273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  57.82 
 
 
273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  57.97 
 
 
334 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  54.55 
 
 
273 aa  332  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  54.71 
 
 
274 aa  330  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  55.07 
 
 
274 aa  330  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  55.11 
 
 
273 aa  330  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  56 
 
 
324 aa  324  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  53.85 
 
 
274 aa  323  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  55.31 
 
 
273 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  55.27 
 
 
324 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  55.27 
 
 
273 aa  322  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  54.91 
 
 
277 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  54.91 
 
 
277 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  54.91 
 
 
277 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  56.73 
 
 
273 aa  322  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  54.74 
 
 
290 aa  321  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  54.41 
 
 
274 aa  321  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  53.65 
 
 
273 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  54.91 
 
 
274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  53.45 
 
 
273 aa  319  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  56.88 
 
 
277 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  55.43 
 
 
338 aa  318  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  57.82 
 
 
273 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  57.82 
 
 
273 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  57.82 
 
 
273 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  55.51 
 
 
322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  56.73 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  56.73 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  51.09 
 
 
322 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  55.07 
 
 
317 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  56.36 
 
 
326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  52.21 
 
 
276 aa  312  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  53.99 
 
 
340 aa  311  9e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  51.65 
 
 
330 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  55.47 
 
 
273 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  50.36 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  50.91 
 
 
272 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  55.11 
 
 
273 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  55.11 
 
 
273 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 
273 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  52.19 
 
 
272 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  51.09 
 
 
272 aa  295  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  49.64 
 
 
273 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  49.64 
 
 
272 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  51.46 
 
 
272 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  51.09 
 
 
272 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  49.09 
 
 
273 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  53.09 
 
 
273 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  48.18 
 
 
324 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  49.45 
 
 
273 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  52 
 
 
273 aa  289  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  52 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  50.55 
 
 
272 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  48.9 
 
 
272 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  48.91 
 
 
328 aa  278  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  48.55 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  51.99 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  48.19 
 
 
274 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  48.19 
 
 
274 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  46.72 
 
 
274 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  48.91 
 
 
274 aa  271  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  47.99 
 
 
276 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  47.83 
 
 
274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  46.76 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  45.45 
 
 
273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  44.36 
 
 
273 aa  265  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  48.36 
 
 
274 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  48.35 
 
 
276 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 
328 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  48.91 
 
 
274 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1660  alpha/beta hydrolase fold  48.21 
 
 
278 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  46.74 
 
 
343 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  47.08 
 
 
273 aa  262  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1889  non-heme chloroperoxidase  47.1 
 
 
274 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108181  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 
276 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  46.93 
 
 
276 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  47.67 
 
 
278 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  47.31 
 
 
342 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  47.5 
 
 
395 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  46.76 
 
 
276 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  47.12 
 
 
276 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  46.76 
 
 
276 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  47.31 
 
 
278 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6378  alpha/beta hydrolase fold  47.31 
 
 
278 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  46.04 
 
 
276 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  46.93 
 
 
276 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  46.79 
 
 
330 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  47.12 
 
 
276 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3920  alpha/beta hydrolase fold protein  47.67 
 
 
278 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3910  alpha/beta hydrolase fold  48.39 
 
 
278 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0228163  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  46.76 
 
 
276 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6475  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 
278 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483706  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  46.35 
 
 
272 aa  255  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>