More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2371 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
377 aa  746    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
394 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
401 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 
378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
386 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  30.05 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
389 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
389 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
389 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
442 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 
387 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 
433 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
383 aa  103  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
377 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
383 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
383 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
376 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
376 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
983 aa  97.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
442 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 
428 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.17 
 
 
405 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
984 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  25.97 
 
 
442 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
392 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
385 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.87 
 
 
394 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
383 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  27.96 
 
 
442 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 
423 aa  89.7  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  27.96 
 
 
442 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  27.96 
 
 
442 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  27.96 
 
 
442 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  27.96 
 
 
442 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  27.96 
 
 
442 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  27.96 
 
 
442 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
382 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
385 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.8 
 
 
378 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
394 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
960 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  31.09 
 
 
440 aa  87  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
382 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3595  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.27 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  27.83 
 
 
436 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  30.85 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
500 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
444 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
444 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  25.71 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
391 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
496 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
444 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  27.23 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  28.91 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  25.76 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 
816 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  29.27 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  29.27 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  28.09 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
816 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  31.2 
 
 
447 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
444 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  29.81 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  30.77 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3704  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.49 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 
383 aa  77  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  29.87 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  29.23 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
444 aa  76.3  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>