19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2348 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2348  Gas vesicle K  100 
 
 		 157 aa  301  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2341  gas vesicle K  70.79 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2388  gas vesicle K  70.79 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2382  gas vesicle K  70.79 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6862  hypothetical protein  59.46 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4699  Gas vesicle K  69.23 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3389  gas vesicle K  64.77 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0706  hypothetical protein  52.75 
 
 		 116 aa  92.8  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1801  Gas vesicle K  52.27 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2406  gas vesicle K  52.94 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3257  gas vesicle K  50 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.224981 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3575  putative gas vesicle synthesis protein  50 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1261  gas vesicle protein K  50 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.16105  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2332  gas vesicle K  46.91 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0074  gas vesicle protein GVPa  47.3 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112832  decreased coverage  0.000485271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2827  hypothetical protein  33.8 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1487  gas vesicle K  30.67 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.48089  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0340  Gas vesicle K  36.51 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0337  hypothetical protein  33.82 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.912911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>