More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2304 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  68.41 
 
 		 500 aa  641    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  100 
 
 		 505 aa  986    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  66.67 
 
 		 508 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  67.01 
 
 		 499 aa  620  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  62.17 
 
 		 510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  64.5 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  61.57 
 
 		 516 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  61.17 
 
 		 509 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  60.77 
 
 		 511 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  61.38 
 
 		 516 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  52.3 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  53.52 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  52.74 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  52.51 
 
 		 519 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  51.02 
 
 		 861 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  45.19 
 
 		 503 aa  481  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 497 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  46.49 
 
 		 524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  52.29 
 
 		 508 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  46.9 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  45.29 
 
 		 512 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  44.83 
 
 		 494 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.58 
 
 		 492 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  44.47 
 
 		 525 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.28 
 
 		 527 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  47 
 
 		 510 aa  455  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  46.6 
 
 		 524 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  46.6 
 
 		 524 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  46.52 
 
 		 523 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.47 
 
 		 525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  48.68 
 
 		 522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  47.88 
 
 		 537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  47.43 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  46.19 
 
 		 524 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.95 
 
 		 513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.89 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  45.97 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.15 
 
 		 492 aa  450  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  47.27 
 
 		 511 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  47.2 
 
 		 511 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  45.66 
 
 		 524 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  47.87 
 
 		 503 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  49.01 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  46.89 
 
 		 525 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.52 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  45.66 
 
 		 524 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  47.13 
 
 		 512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  47.27 
 
 		 511 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  47.13 
 
 		 512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  45.25 
 
 		 524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  44.72 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  45.65 
 
 		 512 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  49.49 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  47.11 
 
 		 521 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  47.35 
 
 		 513 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  47.6 
 
 		 514 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  44.63 
 
 		 515 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  51.5 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  44.93 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  43.69 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  44.49 
 
 		 500 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  46.75 
 
 		 507 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  47.76 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  47.56 
 
 		 497 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  47.76 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.22 
 
 		 499 aa  435  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  42.11 
 
 		 499 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  47.76 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  46.52 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  45.04 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  43.89 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  41.14 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 499 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  43.29 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  44.44 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  47.47 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  46.75 
 
 		 507 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  43.29 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  46.14 
 
 		 497 aa  435  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  47.39 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 		 506 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  47.5 
 
 		 506 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  44.29 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  46.46 
 
 		 508 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  47.53 
 
 		 504 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  42.38 
 
 		 511 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  45.86 
 
 		 507 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  44.26 
 
 		 494 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  44.4 
 
 		 517 aa  425  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  46.44 
 
 		 519 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  43.72 
 
 		 520 aa  425  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.04 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  45.31 
 
 		 503 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  46.95 
 
 		 516 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  40.7 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  43.76 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  43.72 
 
 		 509 aa  426  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  46.46 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>