More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2264 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 		 266 aa  512  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0508  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  58.78 
 
 		 313 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2596  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  56.75 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4045  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  53.49 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344042  normal  0.123945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3669  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  52.9 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  57.37 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4551  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  54.58 
 
 		 275 aa  231  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.357985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  41.26 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  37.36 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  33.96 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.39 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  34.25 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2603  dimethyladenosine transferase  37.05 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  36.48 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  28.98 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1169  dimethyladenosine transferase  31.36 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.013755  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0759  dimethyladenosine transferase  32.16 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0645  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1193  dimethyladenosine transferase  30.04 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  28.52 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  32.04 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  32.35 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  38.54 
 
 		 288 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  33.64 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  37.69 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42375  predicted protein  30.56 
 
 		 320 aa  95.5  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  36.08 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8618  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0873  dimethyladenosine transferase  28.83 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  31.99 
 
 		 302 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf007  dimethyladenosine transferase  30.81 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  27.97 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  30.77 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0706  dimethyladenosine transferase  23.11 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.486021  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0726  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 		 289 aa  92.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.810967  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  26.5 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  25.39 
 
 		 276 aa  92.4  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3312  dimethyladenosine transferase  30.53 
 
 		 285 aa  92  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809842  normal  0.244834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  32.88 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1287  dimethyladenosine transferase  29.96 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.652271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  26.32 
 
 		 294 aa  90.1  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  28.57 
 
 		 298 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  31.44 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  26.81 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  28.97 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2586  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  32.38 
 
 		 331 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.970402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1172  dimethyladenosine transferase  28.57 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  32.47 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  28.69 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1008  dimethyladenosine transferase  34.87 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  31.65 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  30 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  32.38 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  32.64 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1220  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  24.9 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00652696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1343  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  24.9 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2510  rRNA adenine N-6-methyltransferase  24.9 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  27.6 
 
 		 291 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  24.9 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1747  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  24.9 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0257214  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1713  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  24.9 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  24.9 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  22.05 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00110  rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase, putative  28.84 
 
 		 325 aa  86.3  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0222331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  26.7 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0062  dimethyladenosine transferase  29.88 
 
 		 302 aa  85.5  7e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.142341 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  27.81 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  26.76 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  31.47 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  28.76 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3856  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0782  dimethyladenosine transferase  37.31 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  28.84 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  29.8 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  34.09 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  32.42 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  28.04 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  30.48 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  27.73 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  27.73 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  30.23 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  30.2 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  27.67 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  28.9 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  34.62 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1812  dimethyladenosine transferase  22.69 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  24.81 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  26.89 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1513  dimethyladenosine transferase  34.2 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  28.8 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  26.01 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  29.06 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75487  Dimethyladenosine transferase (S-adenosylmethionine-6-N', N'-adenosyl(rRNA) dimethyltransferase) (18S rRNA dimethylase)  29.8 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.368235 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  27.56 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  29.18 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  28.8 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  34.71 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0004  dimethyladenosine transferase  23.56 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.50922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  29.02 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>