More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2256 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  100 
 
 
447 aa  864    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  63.02 
 
 
440 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  61.64 
 
 
442 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  61.1 
 
 
441 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  63.34 
 
 
440 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  62.33 
 
 
441 aa  495  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  61.63 
 
 
444 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  62.08 
 
 
452 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  57.21 
 
 
463 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  57.21 
 
 
463 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  57.21 
 
 
463 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  64.27 
 
 
440 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  64.27 
 
 
440 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  64.27 
 
 
440 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  64.27 
 
 
440 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  64.27 
 
 
440 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  64.27 
 
 
440 aa  477  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  64.27 
 
 
440 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  64.04 
 
 
440 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  60.65 
 
 
436 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  64.04 
 
 
440 aa  474  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  63.11 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  63.11 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  63.11 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  54.87 
 
 
470 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  60.93 
 
 
433 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  63.11 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  63.11 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  54.27 
 
 
470 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  60.93 
 
 
436 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  54.87 
 
 
628 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  58.54 
 
 
452 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  61.45 
 
 
426 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  59.81 
 
 
463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  55.16 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  58.52 
 
 
472 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  59.07 
 
 
437 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  55.45 
 
 
466 aa  448  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  60.53 
 
 
412 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  58.64 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  56.4 
 
 
436 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  55.5 
 
 
428 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  56.64 
 
 
437 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  56.64 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  56.8 
 
 
483 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  56.87 
 
 
437 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  56.64 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.89 
 
 
438 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  55.45 
 
 
435 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  56.16 
 
 
436 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.68 
 
 
435 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.45 
 
 
438 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  57.64 
 
 
456 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  54.9 
 
 
438 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  56.8 
 
 
506 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  55.4 
 
 
431 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  57.45 
 
 
432 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  56.56 
 
 
489 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  55.82 
 
 
435 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  56.75 
 
 
433 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.97 
 
 
432 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  56.56 
 
 
437 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  56.32 
 
 
523 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  59.1 
 
 
437 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  56.56 
 
 
437 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  56.32 
 
 
437 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  56.32 
 
 
437 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  54.42 
 
 
445 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  56.32 
 
 
437 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  54.48 
 
 
434 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  56.52 
 
 
433 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  55.84 
 
 
438 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  49.88 
 
 
436 aa  414  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  55.82 
 
 
420 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  52.59 
 
 
425 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  55.82 
 
 
420 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  56.41 
 
 
442 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  54.87 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1369  MFS family transporter  57.75 
 
 
437 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  55.42 
 
 
420 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  56.39 
 
 
393 aa  398  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.48 
 
 
839 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  48.14 
 
 
440 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4279  major facilitator transporter  51.68 
 
 
426 aa  350  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1295  general substrate transporter  50.72 
 
 
423 aa  333  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  47.88 
 
 
425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  44.57 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  43.02 
 
 
455 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  44.87 
 
 
440 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.96 
 
 
437 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  42.49 
 
 
446 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  44.95 
 
 
461 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  42.35 
 
 
439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  39.86 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  39.86 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  39.86 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  40.99 
 
 
456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  40.09 
 
 
439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  41.26 
 
 
452 aa  306  6e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>