More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2243 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
424 aa  870    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  65.06 
 
 
406 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  52.77 
 
 
368 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  50.36 
 
 
405 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  51.08 
 
 
410 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  50.84 
 
 
405 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  47.84 
 
 
391 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  47.33 
 
 
391 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  50.84 
 
 
410 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  46.17 
 
 
403 aa  359  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  49.88 
 
 
410 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  46.97 
 
 
391 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  45.09 
 
 
395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  47.8 
 
 
408 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  49.87 
 
 
381 aa  349  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  44.84 
 
 
390 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  46.77 
 
 
381 aa  348  8e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  49.48 
 
 
376 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  47.03 
 
 
381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  47.09 
 
 
373 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  50.13 
 
 
381 aa  338  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  49.61 
 
 
381 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  45.45 
 
 
377 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  45.24 
 
 
416 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  42.82 
 
 
367 aa  319  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  42.56 
 
 
367 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  44.08 
 
 
375 aa  313  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  40.05 
 
 
377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  44.58 
 
 
377 aa  309  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  45.09 
 
 
377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  37.86 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  37.86 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  37.86 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  37.86 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  37.6 
 
 
403 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  36.71 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  42.79 
 
 
399 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  40.68 
 
 
393 aa  265  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  42.79 
 
 
399 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  36.69 
 
 
396 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  40.32 
 
 
383 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  40 
 
 
393 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  40.75 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  40.75 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  40.75 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  38.98 
 
 
383 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  40.14 
 
 
417 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  37.06 
 
 
416 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1923  transposase IS605 OrfB family  39.4 
 
 
425 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.846534  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  38.71 
 
 
383 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  39.31 
 
 
392 aa  256  8e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  39.63 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  39.63 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  39.31 
 
 
427 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  36.39 
 
 
399 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  38.64 
 
 
383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  39.84 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  39.59 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  38.58 
 
 
385 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  39.1 
 
 
392 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  36.71 
 
 
383 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  34.59 
 
 
402 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  37.9 
 
 
383 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  42.81 
 
 
326 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  36.65 
 
 
404 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  36.65 
 
 
404 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  37.53 
 
 
385 aa  246  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  37.81 
 
 
391 aa  246  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  35.05 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  38.12 
 
 
371 aa  242  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  35.93 
 
 
461 aa  239  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  37.86 
 
 
370 aa  239  8e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  36.61 
 
 
405 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  36.61 
 
 
405 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  45.36 
 
 
299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  36.14 
 
 
422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  36.55 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  36.55 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  36.15 
 
 
403 aa  234  3e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  36.55 
 
 
370 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  36.03 
 
 
370 aa  232  9e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  36.3 
 
 
402 aa  232  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  36.29 
 
 
370 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0100  IS891/IS1136/IS1341 transposase  33.33 
 
 
401 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  39.45 
 
 
384 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  37.08 
 
 
370 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  36.18 
 
 
394 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  35.38 
 
 
370 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.77 
 
 
372 aa  229  5e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  34.82 
 
 
370 aa  229  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1991  transposase  36.39 
 
 
383 aa  229  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  36.55 
 
 
393 aa  229  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  35.41 
 
 
411 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0256  ISHa1675 transposase B  31.83 
 
 
413 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1254  ISHa1675 transposase B  31.83 
 
 
413 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0163601  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  34.87 
 
 
393 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  35.25 
 
 
370 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1726  ISHa1675 transposase B  31.83 
 
 
413 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.773087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1851  IS605 family transposase OrfB  43.8 
 
 
384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0177268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  35.51 
 
 
370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>