More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2228 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 480 aa  926    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.73 
 
 		 475 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.38 
 
 		 483 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.27 
 
 		 461 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.08 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.8 
 
 		 517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  49.89 
 
 		 488 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.6 
 
 		 506 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  47.38 
 
 		 487 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.24 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  46.52 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.21 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  46.22 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.07 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.27 
 
 		 491 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.93 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.31 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.19 
 
 		 481 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.88 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.28 
 
 		 521 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  46 
 
 		 491 aa  375  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.15 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.98 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.08 
 
 		 479 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.37 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.27 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.2 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.49 
 
 		 471 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.49 
 
 		 471 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.49 
 
 		 471 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  46.01 
 
 		 484 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  45.55 
 
 		 502 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.26 
 
 		 470 aa  352  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.45 
 
 		 518 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  47.87 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.56 
 
 		 465 aa  313  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  42.67 
 
 		 456 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.38 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.95 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.32 
 
 		 460 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.27 
 
 		 496 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.7 
 
 		 442 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.93 
 
 		 438 aa  266  5.999999999999999e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.48 
 
 		 438 aa  259  8e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.85 
 
 		 463 aa  258  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.31 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.48 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  32.61 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.33 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.26 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.33 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.26 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  35.99 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  35.68 
 
 		 429 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.59 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.31 
 
 		 466 aa  243  6e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.13 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.42 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.84 
 
 		 440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.06 
 
 		 441 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.2 
 
 		 433 aa  239  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.91 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  31.32 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.36 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.78 
 
 		 442 aa  237  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  35.92 
 
 		 437 aa  237  4e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.82 
 
 		 471 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  31.96 
 
 		 443 aa  236  9e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.66 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  34.86 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.53 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  33.55 
 
 		 434 aa  233  7.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  36.15 
 
 		 458 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.71 
 
 		 436 aa  232  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.14 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.12 
 
 		 428 aa  231  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1698  Xanthine/uracil/vitamin C permease  32.97 
 
 		 433 aa  231  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.73 
 
 		 435 aa  230  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  33.26 
 
 		 430 aa  229  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1032  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.29 
 
 		 433 aa  229  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  34.79 
 
 		 430 aa  229  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  32.1 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0224  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.24 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274555  normal  0.678538 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  33.91 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  31.95 
 
 		 429 aa  227  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.63 
 
 		 449 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  32.89 
 
 		 429 aa  226  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1867  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.85 
 
 		 455 aa  226  7e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000230048  hitchhiker  0.00000000132441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.15 
 
 		 431 aa  226  8e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  34.87 
 
 		 434 aa  226  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  33.85 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.97 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.21 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.21 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2295  xanthine/uracil/vitamin C transporter  33.12 
 
 		 436 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.46 
 
 		 443 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.6 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  33.85 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  34.35 
 
 		 445 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  35.04 
 
 		 453 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>