143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2218 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 
373 aa  764  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  2.48753e-07  decreased coverage  8.5459e-07 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  46.27 
 
 
491 aa  324  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  42.06 
 
 
371 aa  306  4e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  44.55 
 
 
474 aa  306  5e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  48.36 
 
 
477 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  42.24 
 
 
488 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  37.85 
 
 
503 aa  285  8e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  40.77 
 
 
399 aa  285  9e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  39.57 
 
 
837 aa  283  4e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  46.18 
 
 
376 aa  282  6e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  41.64 
 
 
778 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  39.42 
 
 
678 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  39.88 
 
 
487 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  38.29 
 
 
490 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  42.62 
 
 
543 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  42.59 
 
 
451 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  42.38 
 
 
394 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  41.02 
 
 
398 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  37.24 
 
 
347 aa  254  1e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  37.54 
 
 
347 aa  254  1e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  34.01 
 
 
423 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  41.67 
 
 
383 aa  249  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 
628 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  40.66 
 
 
457 aa  229  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  36.22 
 
 
328 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  36.98 
 
 
333 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  2.8358e-05  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  38.61 
 
 
317 aa  225  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  36.51 
 
 
389 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  37.31 
 
 
375 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  37 
 
 
497 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  36.75 
 
 
495 aa  206  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  35.22 
 
 
815 aa  203  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  36.96 
 
 
1001 aa  201  2e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  35.31 
 
 
323 aa  201  2e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  36.1 
 
 
829 aa  197  2e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  35.14 
 
 
309 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  34.47 
 
 
321 aa  193  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  35.76 
 
 
457 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  35.95 
 
 
474 aa  192  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  37.87 
 
 
370 aa  192  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  5.0608e-06 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  35.55 
 
 
454 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  33.14 
 
 
820 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  32.58 
 
 
472 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  35.47 
 
 
465 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  33.94 
 
 
1037 aa  185  9e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  8.95355e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.52 
 
 
697 aa  185  1e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  34.97 
 
 
451 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  34.57 
 
 
756 aa  184  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  32.82 
 
 
331 aa  183  5e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  31.61 
 
 
366 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  31.27 
 
 
423 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  33.05 
 
 
373 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  31.15 
 
 
1478 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  33.33 
 
 
357 aa  175  1e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  30 
 
 
689 aa  175  1e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  31.82 
 
 
359 aa  174  3e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  6.50557e-06  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  26.95 
 
 
369 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  32.7 
 
 
374 aa  169  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  1.12994e-09  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  33.23 
 
 
566 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  32.47 
 
 
321 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  31.66 
 
 
337 aa  166  6e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  29.86 
 
 
355 aa  165  1e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  32.25 
 
 
561 aa  164  2e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  30.86 
 
 
324 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  34.01 
 
 
381 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  30.82 
 
 
1041 aa  162  8e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  32.92 
 
 
1019 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  33.12 
 
 
1018 aa  159  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  30.99 
 
 
407 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  27.7 
 
 
370 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  27.3 
 
 
364 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  33.55 
 
 
619 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  31.53 
 
 
401 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  30.03 
 
 
1050 aa  156  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  32.54 
 
 
338 aa  156  5e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  30.46 
 
 
486 aa  156  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  31.25 
 
 
382 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  30.45 
 
 
1059 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  30.45 
 
 
1059 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.3 
 
 
770 aa  148  1e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  31.23 
 
 
1020 aa  147  4e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  31.6 
 
 
368 aa  147  4e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  32.03 
 
 
388 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  32.75 
 
 
370 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  26.29 
 
 
387 aa  142  1e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  24.84 
 
 
463 aa  142  1e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  27.37 
 
 
1495 aa  140  2e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  27.06 
 
 
357 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  27.6 
 
 
382 aa  137  3e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  25.76 
 
 
357 aa  135  1e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  29.39 
 
 
806 aa  134  2e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 
619 aa  130  5e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  30.67 
 
 
912 aa  130  5e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.14 
 
 
1146 aa  129  8e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  31.8 
 
 
392 aa  125  8e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  31.78 
 
 
1331 aa  120  4e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  30.49 
 
 
1780 aa  116  7e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  28.57 
 
 
690 aa  114  4e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 
1077 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  26.51 
 
 
756 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.71039e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>