More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2217 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  100 
 
 
417 aa  840  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  2.07738e-07  decreased coverage  9.04548e-07 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  45.09 
 
 
409 aa  306  5e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  43.17 
 
 
450 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  40.75 
 
 
464 aa  259  5e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  43.68 
 
 
402 aa  259  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  41.56 
 
 
398 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  39.13 
 
 
430 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  42.55 
 
 
401 aa  249  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  37.01 
 
 
447 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  37.01 
 
 
447 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  36.61 
 
 
407 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  36.61 
 
 
407 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  36.76 
 
 
447 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  36.61 
 
 
407 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.76 
 
 
426 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  37.88 
 
 
409 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  38.22 
 
 
405 aa  235  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.92 
 
 
399 aa  234  2e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  39.32 
 
 
435 aa  234  2e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  42.38 
 
 
416 aa  234  2e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  39.14 
 
 
431 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  39.08 
 
 
418 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  37.5 
 
 
443 aa  233  7e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  39.89 
 
 
399 aa  232  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  40.66 
 
 
387 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  36.87 
 
 
405 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  39.43 
 
 
414 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  37.98 
 
 
423 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.15 
 
 
411 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  40.1 
 
 
427 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.82 
 
 
429 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  36.12 
 
 
438 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  39.64 
 
 
404 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  42.45 
 
 
417 aa  226  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38.7 
 
 
410 aa  226  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  38.28 
 
 
402 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  36.04 
 
 
414 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  38.05 
 
 
411 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  37.65 
 
 
411 aa  223  5e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08493e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  37.21 
 
 
410 aa  223  5e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  36.43 
 
 
408 aa  223  5e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.91 
 
 
405 aa  223  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.56 
 
 
388 aa  222  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  38.05 
 
 
411 aa  222  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  37.35 
 
 
411 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  37.35 
 
 
411 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  37.65 
 
 
411 aa  222  1e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  35.2 
 
 
420 aa  221  2e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  38.54 
 
 
406 aa  221  2e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  36.45 
 
 
417 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  37.94 
 
 
410 aa  220  4e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  36.48 
 
 
411 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.54 
 
 
410 aa  219  9e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  37.18 
 
 
405 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  36.71 
 
 
412 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  43.3 
 
 
418 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  37.21 
 
 
413 aa  217  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  36.79 
 
 
411 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  36.73 
 
 
411 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  36.79 
 
 
411 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  36.8 
 
 
422 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  36.46 
 
 
412 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  37.94 
 
 
412 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  39.06 
 
 
402 aa  216  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  36.34 
 
 
414 aa  216  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  34.7 
 
 
444 aa  215  1e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  8.66708e-05  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  34.93 
 
 
419 aa  215  1e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.17 
 
 
411 aa  214  2e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  32.07 
 
 
411 aa  213  5e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  37.4 
 
 
404 aa  213  6e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.46 
 
 
380 aa  213  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  35.49 
 
 
400 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  36.46 
 
 
402 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  37.36 
 
 
400 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  31.57 
 
 
411 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  37.35 
 
 
411 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  36.73 
 
 
398 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  36.77 
 
 
408 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  38.96 
 
 
401 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.44 
 
 
411 aa  210  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  37.87 
 
 
398 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  38.13 
 
 
396 aa  210  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.04 
 
 
412 aa  209  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  34.34 
 
 
408 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  37.09 
 
 
399 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  38.03 
 
 
405 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  31.06 
 
 
408 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  31.43 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  35.68 
 
 
417 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  37.4 
 
 
406 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  39.9 
 
 
423 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  35.99 
 
 
402 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  35.07 
 
 
442 aa  206  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  39.69 
 
 
407 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  36.76 
 
 
413 aa  206  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  37.73 
 
 
398 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  33.77 
 
 
415 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.81 
 
 
406 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  37.13 
 
 
393 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  35.96 
 
 
390 aa  203  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>