More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2193 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2193  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 
267 aa  534  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  9.41808e-08  hitchhiker  0.000239022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1541  AP endonuclease  76.89 
 
 
267 aa  415  1e-115  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3225  exodeoxyribonuclease III Xth  66.17 
 
 
265 aa  362  3e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  hitchhiker  2.09509e-06 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5745  exodeoxyribonuclease III Xth  62.88 
 
 
294 aa  357  2e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6475  exodeoxyribonuclease III Xth  67.17 
 
 
264 aa  355  6e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05100  exodeoxyribonuclease III  66.54 
 
 
265 aa  353  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0948  exodeoxyribonuclease III Xth  57.72 
 
 
272 aa  302  3e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.875165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1556  exodeoxyribonuclease III Xth  54.81 
 
 
270 aa  283  2e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1238  exodeoxyribonuclease III Xth  57.78 
 
 
263 aa  283  2e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.15014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4873  exodeoxyribonuclease III Xth  55.72 
 
 
274 aa  282  5e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0668549  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1211  exodeoxyribonuclease III (xth)  57.41 
 
 
263 aa  281  7e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1228  exodeoxyribonuclease III Xth  57.41 
 
 
263 aa  281  7e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879131  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  48.31 
 
 
257 aa  271  8e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  49.24 
 
 
256 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  48.48 
 
 
256 aa  268  9e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  48.5 
 
 
257 aa  268  9e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  48.48 
 
 
256 aa  268  9e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  48.5 
 
 
257 aa  268  9e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  48.48 
 
 
256 aa  268  9e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  48.5 
 
 
257 aa  268  9e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  48.48 
 
 
256 aa  268  9e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  48.48 
 
 
256 aa  268  9e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  48.48 
 
 
256 aa  268  9e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  48.48 
 
 
256 aa  268  9e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  47.74 
 
 
256 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  47.57 
 
 
257 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  47.57 
 
 
257 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  48.13 
 
 
259 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0070  exodeoxyribonuclease III Xth  50.38 
 
 
257 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  46.97 
 
 
258 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  46.82 
 
 
261 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.43 
 
 
259 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  46.47 
 
 
261 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  46.47 
 
 
261 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  46.04 
 
 
260 aa  255  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  48.5 
 
 
259 aa  254  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0039  exodeoxyribonuclease III Xth  47.74 
 
 
256 aa  254  8e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  46.59 
 
 
259 aa  254  1e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  46.99 
 
 
259 aa  253  2e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  44.91 
 
 
260 aa  253  2e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  46.99 
 
 
259 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  48.12 
 
 
257 aa  252  4e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  47.55 
 
 
260 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  45.86 
 
 
260 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  45.86 
 
 
260 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1767  exodeoxyribonuclease III Xth  50.18 
 
 
278 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0109  exodeoxyribonuclease III Xth  46.82 
 
 
261 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0626468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  45.83 
 
 
257 aa  244  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  45.08 
 
 
258 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  46.95 
 
 
277 aa  238  6e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.88572e-07 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  43.12 
 
 
263 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  44.32 
 
 
267 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3979  exodeoxyribonuclease III Xth  47.04 
 
 
273 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  41.09 
 
 
267 aa  228  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0403  exodeoxyribonuclease III  43.28 
 
 
259 aa  227  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  41.09 
 
 
267 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21350  exodeoxyribonuclease III Xth  48.2 
 
 
273 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0288  exodeoxyribonuclease III Xth  42.49 
 
 
264 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0138  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.93 
 
 
266 aa  225  5e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.287048  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1784  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 
259 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  43.7 
 
 
262 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21179e-06 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0121  exodeoxyribonuclease III Xth  44.57 
 
 
266 aa  221  9e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00155792  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04750  exodeoxyribonuclease III  48.19 
 
 
308 aa  221  1e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.989341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2985  exodeoxyribonuclease III Xth  48.16 
 
 
269 aa  220  2e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47396  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02934  exodeoxyribonuclease III  45.45 
 
 
266 aa  219  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  41.97 
 
 
267 aa  218  9e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10160  exodeoxyribonuclease III  42.31 
 
 
307 aa  216  3e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0295  exodeoxyribonuclease III Xth  43.64 
 
 
266 aa  216  3e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.049779 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0258  exonuclease III  41.96 
 
 
286 aa  213  2e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209471  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30930  exodeoxyribonuclease III Xth  41.35 
 
 
308 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0698  exodeoxyribonuclease III Xth  43.43 
 
 
287 aa  209  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.13034  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1619  exodeoxyribonuclease III Xth  41.82 
 
 
266 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.8373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0089  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.02 
 
 
263 aa  205  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2498  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 
276 aa  205  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27900  exodeoxyribonuclease III Xth  45.96 
 
 
266 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408548  normal  0.79978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0167  exodeoxyribonuclease III Xth  35.83 
 
 
319 aa  201  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201775  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0490  putative exodeoxyribonuclease III  38.41 
 
 
288 aa  201  1e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  39.69 
 
 
254 aa  197  1e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1121  exodeoxyribonuclease III Xth  44.8 
 
 
273 aa  197  1e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2277  exodeoxyribonuclease III Xth  41.67 
 
 
291 aa  196  5e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0757  exodeoxyribonuclease III Xth  43.06 
 
 
279 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.198669  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  37.5 
 
 
256 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0618  exodeoxyribonuclease III Xth  35.45 
 
 
258 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  1.57128e-12 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  39.31 
 
 
252 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0180  exodeoxyribonuclease III Xth  38.11 
 
 
259 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.101584  hitchhiker  7.10685e-06 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  37.64 
 
 
254 aa  184  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5200  exodeoxyribonuclease III Xth  38.49 
 
 
259 aa  184  1e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5292  exodeoxyribonuclease III Xth  38.49 
 
 
259 aa  184  1e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.328538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5341  exodeoxyribonuclease III Xth  38.49 
 
 
259 aa  184  1e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11599  hitchhiker  0.00893933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  37.02 
 
 
254 aa  183  2e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6108  catabolite repression control protein  38.87 
 
 
259 aa  182  4e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70390  catabolite repression control protein  38.87 
 
 
259 aa  182  4e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  39.31 
 
 
252 aa  181  9e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1797e-11 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  39.31 
 
 
252 aa  181  9e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  39.31 
 
 
252 aa  181  9e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  38.93 
 
 
252 aa  181  9e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02870  catabolite repression control protein; Crc  38.11 
 
 
259 aa  181  9e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01760  exodeoxyribonuclease  38.78 
 
 
254 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  39.1 
 
 
253 aa  179  3e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5545  exodeoxyribonuclease III xth  37.74 
 
 
259 aa  179  3e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>