More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2192 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
248 aa  485  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  9.41808e-08  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  66.4 
 
 
264 aa  320  1e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  47.08 
 
 
246 aa  191  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1557  hypothetical protein  48.31 
 
 
241 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0656  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  46.98 
 
 
241 aa  168  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1525  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.96 
 
 
245 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169593  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3111  putative hydrolase  38.91 
 
 
258 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  35.5 
 
 
256 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.4 
 
 
301 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  37.44 
 
 
262 aa  125  8e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0770  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
268 aa  121  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 
265 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2020  alpha/beta hydrolase fold protein  34.76 
 
 
216 aa  113  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  32.02 
 
 
265 aa  99  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 
243 aa  74.3  2e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
279 aa  72  7e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 
227 aa  70.9  2e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
265 aa  67.8  2e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.7 
 
 
283 aa  67.4  2e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  21.81 
 
 
277 aa  67.4  2e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 
236 aa  67  3e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 
264 aa  65.9  5e-10  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3691  putative hydrolase  28.79 
 
 
259 aa  65.5  8e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.13 
 
 
271 aa  63.9  2e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
265 aa  63.5  3e-09  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 
276 aa  63.2  3e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
261 aa  63.5  3e-09  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
284 aa  62.4  6e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.9 
 
 
256 aa  62  8e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.9 
 
 
256 aa  62  8e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
278 aa  62  9e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  1.0023e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 
270 aa  62  9e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 
265 aa  62  9e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
279 aa  62  9e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.9 
 
 
256 aa  61.6  1e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.8 
 
 
270 aa  61.2  2e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
270 aa  60.8  2e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
307 aa  60.5  2e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.48 
 
 
270 aa  60.8  2e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 
261 aa  60.1  3e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  39.42 
 
 
294 aa  60.1  3e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
278 aa  60.5  3e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
256 aa  60.5  3e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 
392 aa  59.3  5e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
246 aa  59.3  5e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 
264 aa  59.3  5e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
263 aa  59.7  5e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  29.83 
 
 
253 aa  59.3  5e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0532502  normal  0.345271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.28 
 
 
266 aa  59.3  5e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  26.69 
 
 
275 aa  59.3  5e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0027  hydrolase, alpha/beta superfamily, CesH  21.16 
 
 
260 aa  59.7  5e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  36.96 
 
 
279 aa  58.9  6e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.64 
 
 
270 aa  58.9  7e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.87 
 
 
265 aa  58.9  8e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 
267 aa  58.9  8e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.4 
 
 
263 aa  58.5  9e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  37.63 
 
 
278 aa  58.5  1e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25.97 
 
 
270 aa  57.8  1e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
282 aa  58.2  1e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.66 
 
 
261 aa  58.2  1e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.424876  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
282 aa  58.2  1e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  38.71 
 
 
238 aa  58.2  1e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.64 
 
 
270 aa  58.2  1e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 
270 aa  58.5  1e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
255 aa  57.8  2e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 
277 aa  57.8  2e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
260 aa  57.8  2e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
270 aa  57.4  2e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 
237 aa  57.8  2e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  38.46 
 
 
261 aa  57.8  2e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
272 aa  57.8  2e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
271 aa  57  3e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.24 
 
 
259 aa  57  3e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2303  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
300 aa  57  3e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379663 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 
226 aa  56.6  3e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 
282 aa  57  3e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.79 
 
 
270 aa  56.6  4e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 
263 aa  56.6  4e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
284 aa  56.6  4e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
260 aa  56.2  5e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.25 
 
 
270 aa  55.8  6e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.25 
 
 
270 aa  55.8  6e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
263 aa  55.8  6e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
254 aa  55.8  6e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  31.03 
 
 
266 aa  55.5  7e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
261 aa  55.5  7e-07  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 
262 aa  55.5  8e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
308 aa  55.5  8e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
278 aa  55.5  8e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 
257 aa  54.7  1e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
258 aa  55.1  1e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
278 aa  55.1  1e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 
280 aa  54.3  2e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
271 aa  53.9  2e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
267 aa  53.9  2e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 
268 aa  53.9  2e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 
257 aa  54.3  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
235 aa  54.3  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  2.42559e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.51 
 
 
278 aa  53.9  2e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 
271 aa  54.3  2e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>