More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2181 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  100 
 
 
239 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  65.96 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  62.77 
 
 
213 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  44.85 
 
 
167 aa  122  6e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  59.38 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1527  rare lipoprotein A  62.89 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  61.29 
 
 
179 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  52.83 
 
 
127 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  55.77 
 
 
360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  55.77 
 
 
360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
342 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  60.49 
 
 
181 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  46.34 
 
 
367 aa  106  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
163 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
170 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  68.57 
 
 
121 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  57.47 
 
 
214 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
371 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  57.47 
 
 
150 aa  104  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  56.32 
 
 
203 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
324 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  50.88 
 
 
165 aa  104  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  56.32 
 
 
203 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  45.38 
 
 
203 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  65.71 
 
 
121 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  45.38 
 
 
213 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
171 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  57.65 
 
 
163 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
322 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  56.32 
 
 
200 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  45.38 
 
 
213 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  62.34 
 
 
122 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  54.44 
 
 
239 aa  102  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  68.57 
 
 
261 aa  102  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  50.48 
 
 
200 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  64.38 
 
 
199 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
199 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  47.32 
 
 
171 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
127 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0038  putative lipoprotein A  60.27 
 
 
122 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
335 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
119 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  60 
 
 
122 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0046  rare lipoprotein A  60.27 
 
 
120 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  64.29 
 
 
121 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
198 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
259 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  39.72 
 
 
265 aa  99.8  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
262 aa  100  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  64.79 
 
 
142 aa  99.8  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  55.17 
 
 
202 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 
211 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 
242 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 
230 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 
211 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 
211 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 
211 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  52.81 
 
 
134 aa  99.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 
242 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  54.44 
 
 
230 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
157 aa  99  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  43.22 
 
 
206 aa  98.6  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  60.56 
 
 
94 aa  98.6  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
238 aa  98.2  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  44.25 
 
 
206 aa  98.6  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  40.46 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
115 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
124 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  54.88 
 
 
140 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  40.46 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  53.33 
 
 
125 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
115 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  40.46 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  49.51 
 
 
129 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  51.52 
 
 
323 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  51.58 
 
 
125 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  55.95 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  49.49 
 
 
270 aa  97.1  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  51.69 
 
 
124 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
270 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  48.89 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  63.01 
 
 
115 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  46.36 
 
 
137 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  50.48 
 
 
162 aa  97.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  45.45 
 
 
137 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  60.81 
 
 
168 aa  96.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4680  rare lipoprotein A  47.32 
 
 
199 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  50 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  56.18 
 
 
238 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  45.45 
 
 
137 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  47.78 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  56.99 
 
 
204 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  49.49 
 
 
124 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  45.45 
 
 
137 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  50 
 
 
246 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  43.93 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  55.29 
 
 
471 aa  95.5  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>