More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2162 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 338 aa  672    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  44.48 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  38.72 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  36.12 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 		 299 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  34.23 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  31.55 
 
 		 303 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  39.9 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 304 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  38.53 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  38.53 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  34.92 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  21.78 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 131 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  23.15 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 174 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 144 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 134 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  32.73 
 
 		 169 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 136 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  24.39 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.42 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 		 154 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 136 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 630 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 630 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  40 
 
 		 133 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 254 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 254 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 648 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 134 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 134 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 250 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  28.1 
 
 		 250 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 134 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  25.2 
 
 		 252 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 134 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  29.84 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  22.42 
 
 		 253 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  26.06 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  29.22 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  22.42 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 150 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 639 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 141 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  39.39 
 
 		 133 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>