168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2124 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  69.19 
 
 		 190 aa  258  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  67.57 
 
 		 196 aa  231  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  67.72 
 
 		 194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  61.86 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  51.58 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 221 aa  90.9  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  39.16 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  39.83 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  30.41 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  41.24 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  33.09 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  33.09 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 414 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 234 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  41.38 
 
 		 241 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  31.62 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  52 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 226 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  27.37 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 214 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0862  hypothetical protein  42.86 
 
 		 232 aa  47.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal  0.0703318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  27.7 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 429 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  28.57 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  34.19 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  39.68 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  36.67 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 245 aa  44.7  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  31.39 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 403 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  49.12 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  27.73 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  27.1 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 428 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>