More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2109 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  74.78 
 
 		 472 aa  650    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  100 
 
 		 475 aa  924    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  64.56 
 
 		 469 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  60.96 
 
 		 479 aa  478  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  52.5 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  53.93 
 
 		 544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  52.87 
 
 		 486 aa  445  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  53.7 
 
 		 487 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  52.2 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  51.23 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  52.12 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  53.85 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  54.64 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  48.48 
 
 		 478 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  50.54 
 
 		 485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  49.89 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  51.27 
 
 		 492 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  48.95 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  51.27 
 
 		 492 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  50.21 
 
 		 496 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  51.27 
 
 		 492 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  50.88 
 
 		 479 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  49.16 
 
 		 479 aa  392  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  52.52 
 
 		 494 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  53.96 
 
 		 491 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  45.73 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  44.71 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  52.31 
 
 		 490 aa  385  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  45.91 
 
 		 474 aa  381  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  45.44 
 
 		 470 aa  364  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  42.74 
 
 		 480 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  45.28 
 
 		 468 aa  360  4e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  37.68 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  38.6 
 
 		 448 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  36.75 
 
 		 475 aa  296  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  36.24 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  38.39 
 
 		 467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  36.71 
 
 		 491 aa  287  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  36.71 
 
 		 491 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  36.71 
 
 		 491 aa  286  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  36.71 
 
 		 491 aa  286  8e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  36.71 
 
 		 491 aa  286  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  36.71 
 
 		 491 aa  286  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  36.71 
 
 		 491 aa  286  8e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  36.67 
 
 		 468 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  33.12 
 
 		 477 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  36.31 
 
 		 491 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  36.4 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  37.47 
 
 		 492 aa  266  5.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  36.87 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  36.81 
 
 		 464 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  36.44 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  35.86 
 
 		 480 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  35.1 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  33.04 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  36.12 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  35.87 
 
 		 457 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  32.4 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  33.99 
 
 		 443 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  33.78 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  34.92 
 
 		 446 aa  243  7e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  34.8 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  35.48 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  35.56 
 
 		 466 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4701  sugar transporter  30.66 
 
 		 478 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  31.13 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  36.82 
 
 		 468 aa  236  9e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  34.98 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  37.39 
 
 		 447 aa  233  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  34.51 
 
 		 445 aa  233  8.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  34.26 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  31.92 
 
 		 484 aa  231  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  33.4 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  33.19 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  34.07 
 
 		 516 aa  223  9e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  32.97 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  33.48 
 
 		 533 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  32.11 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  31.52 
 
 		 471 aa  219  7.999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  32.77 
 
 		 474 aa  219  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  32.07 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  32.89 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  32.55 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  31.21 
 
 		 524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  31.2 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  32.82 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  34.59 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2136  sugar transporter  34.27 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  32.39 
 
 		 437 aa  209  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  31.05 
 
 		 480 aa  207  4e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  32.74 
 
 		 468 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  31.33 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  30.8 
 
 		 473 aa  202  9e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  29.68 
 
 		 561 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  33.63 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  33.63 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  30.09 
 
 		 472 aa  201  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  30.39 
 
 		 472 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  30.39 
 
 		 472 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  32.23 
 
 		 507 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>