29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2107 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  320  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  40.87 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  45.05 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1320  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.601937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  37.04 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1737  hypothetical protein  35.78 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4174  hypothetical protein  35.05 
 
 
185 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.044221  normal  0.709367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  36.89 
 
 
135 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  52.5 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  52.5 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  32.11 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  34.31 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  34.31 
 
 
140 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2917  hypothetical protein  35.71 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  34.31 
 
 
140 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  31.76 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  31.96 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  31.43 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  28.32 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  33.02 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  34.48 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  28 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  34.91 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2879  hypothetical protein  36.79 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494384  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  30.33 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  28.24 
 
 
143 aa  40.8  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  28.4 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  29.41 
 
 
178 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>