32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2089 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  100 
 
 		 409 aa  821    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  32.61 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  28.42 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  25 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2147  membrane protein-like protein  26.16 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231192  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  29.63 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  28.87 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5223  membrane protein-like protein  26.86 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  24.6 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  27.23 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  28.7 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0817  membrane protein-like  30 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1021  protein of unknown function DUF939  25.82 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  30.61 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  25.93 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  28.52 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  28.14 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0445  hypothetical protein  24.44 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  25.76 
 
 		 369 aa  47  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4792  putative lipoprotein  24.81 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0533  putative lipoprotein  24.81 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0945445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0584  putative lipoprotein  23.68 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0585  putative lipoprotein  23.68 
 
 		 362 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0482  protein of unknown function DUF939  30.2 
 
 		 353 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0512  putative lipoprotein  23.68 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0529  putative lipoprotein  23.68 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0436  hypothetical protein  23.68 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0468809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0440  hypothetical protein  23.68 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0497  putative lipoprotein  23.68 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  26.91 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  29.41 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>