More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2028 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 194 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  67.89 
 
 		 198 aa  265  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  69.31 
 
 		 195 aa  259  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  65.79 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  64.74 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 196 aa  248  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  63.68 
 
 		 202 aa  244  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  64.95 
 
 		 194 aa  242  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  61.58 
 
 		 191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  65.61 
 
 		 192 aa  238  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  66.14 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  62.7 
 
 		 197 aa  235  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  60.53 
 
 		 191 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  63.1 
 
 		 201 aa  234  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  63.3 
 
 		 200 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  65.43 
 
 		 194 aa  232  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 219 aa  231  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  62.23 
 
 		 223 aa  231  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  58.85 
 
 		 199 aa  231  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  63.93 
 
 		 200 aa  224  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  63.64 
 
 		 204 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  58.6 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  64.29 
 
 		 195 aa  218  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  59.16 
 
 		 197 aa  216  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  62.83 
 
 		 210 aa  211  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  55.8 
 
 		 197 aa  201  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  57.22 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  51.34 
 
 		 192 aa  198  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  54.64 
 
 		 190 aa  185  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  56.38 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  51.53 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  46.06 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  41.8 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.46 
 
 		 126 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  40.21 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  42.29 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  38.02 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  38.07 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  41.01 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  32.42 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  38.22 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  29.35 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  29.84 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  29.12 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  25 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  26.9 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1064  transciptional regulator  24.39 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  31.21 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  25.42 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  27.66 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  29.44 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  30.64 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  25.68 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  25.68 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  30.64 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  25.41 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  28.31 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  27.84 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  26.23 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  27.17 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  25.71 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  26.7 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>