More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2007 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 250 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  46.34 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  52.02 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  46.89 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  46.43 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  48.98 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.06 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  41.77 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.08 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  40.62 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.5 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.08 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.05 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  41.34 
 
 		 261 aa  128  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  37.73 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.29 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  36.26 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  35.88 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  35.02 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  33.8 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  37.65 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  35.04 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  34.26 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.7 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  34.18 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  34.12 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  39.33 
 
 		 312 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  32.84 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  34.12 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  35.19 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  31.23 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  30.56 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  36.19 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  31.35 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  34.26 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  30.35 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  27.49 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  35.12 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  30.43 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  29.41 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  31.34 
 
 		 251 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  30.41 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  32.77 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  30.68 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  31.73 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 		 298 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  32.51 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  32 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  32 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  32.11 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  32.11 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 258 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  31.96 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  39.58 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  31.6 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  36.45 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  31.43 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  33.17 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.54 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  29.52 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  34.07 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  29.37 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  31.05 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  30.69 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 		 308 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  31.1 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0075  hypothetical protein  31.25 
 
 		 305 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.22 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  36.05 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  30.97 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000218299  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  30.24 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  31.19 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  31.19 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.65 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  31.19 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  29.71 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  34.9 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.82 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  33.19 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  31.44 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  35.92 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>