73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1987 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1987  putative integral membrane protein  100 
 
 
552 aa  1047    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285044  hitchhiker  0.000714658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2315  hypothetical protein  32.99 
 
 
609 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.48 
 
 
691 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1282  hypothetical protein  21.21 
 
 
632 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1493  hypothetical protein  21.4 
 
 
632 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00418774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  30.02 
 
 
534 aa  115  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  23.53 
 
 
650 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  33.18 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  34.85 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  39.06 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4168  hypothetical protein  32.59 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  36.43 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0149  hypothetical protein  34.43 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  33.63 
 
 
357 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  37.14 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0661  hypothetical protein  33.33 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.238233  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  36.03 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1375  hypothetical protein  32.46 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0582  hypothetical protein  33.33 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1110  hypothetical protein  33.61 
 
 
379 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0138  hypothetical protein  32.38 
 
 
375 aa  64.7  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0479408  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2067  hypothetical protein  27.06 
 
 
638 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012683  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.37 
 
 
699 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  36.07 
 
 
700 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3840  hypothetical protein  39.72 
 
 
376 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  34.16 
 
 
371 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0517  hypothetical protein  34.44 
 
 
363 aa  60.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1033  hypothetical protein  33.86 
 
 
367 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  28.66 
 
 
733 aa  58.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2812  hypothetical protein  34.16 
 
 
363 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0873158  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.81 
 
 
719 aa  57  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  39.53 
 
 
358 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2586  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.94 
 
 
651 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2534  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.94 
 
 
651 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2789  hypothetical protein  38.1 
 
 
372 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  31.54 
 
 
688 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0290  hypothetical protein  33.05 
 
 
351 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  31.52 
 
 
359 aa  48.5  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  30.25 
 
 
347 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.82 
 
 
738 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.47 
 
 
708 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  33.62 
 
 
740 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.95 
 
 
738 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  24.49 
 
 
758 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  23.11 
 
 
851 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.45 
 
 
746 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.7 
 
 
737 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  27.06 
 
 
717 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  27.06 
 
 
720 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  27.06 
 
 
720 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  27.06 
 
 
720 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  27.06 
 
 
720 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  27.06 
 
 
720 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  27.06 
 
 
717 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  22.67 
 
 
883 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  27.65 
 
 
727 aa  45.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.23 
 
 
806 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  31.3 
 
 
733 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  24.49 
 
 
758 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  24.49 
 
 
758 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  24.49 
 
 
758 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  26.26 
 
 
764 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  24.49 
 
 
758 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  24.49 
 
 
758 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  24.49 
 
 
758 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  24.49 
 
 
758 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  32.32 
 
 
717 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  26.47 
 
 
720 aa  43.5  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  32.32 
 
 
717 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  32.32 
 
 
717 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  28.27 
 
 
680 aa  43.5  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  32.32 
 
 
717 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  32.32 
 
 
717 aa  43.5  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.649657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>