More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1977 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
393 aa  780  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  4.20901e-05  unclonable  4.4053e-08 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  56.58 
 
 
396 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  52.19 
 
 
388 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  6.65044e-06 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  50.9 
 
 
388 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  48.35 
 
 
395 aa  316  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  43.49 
 
 
387 aa  236  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  37.79 
 
 
418 aa  213  3e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  36.13 
 
 
394 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  37.27 
 
 
496 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  35.48 
 
 
390 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.589e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  39.74 
 
 
396 aa  201  2e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  35.81 
 
 
388 aa  199  8e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.90201e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  39.2 
 
 
381 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
413 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  34.32 
 
 
402 aa  184  2e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  36.75 
 
 
389 aa  179  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  3.60209e-06  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  36.08 
 
 
388 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  35.06 
 
 
391 aa  175  1e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  37.75 
 
 
400 aa  174  2e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  33.99 
 
 
407 aa  166  7e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  34.11 
 
 
399 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  35.94 
 
 
372 aa  164  2e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  32.72 
 
 
402 aa  163  4e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  34.97 
 
 
400 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  32.61 
 
 
377 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  33.17 
 
 
404 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  34.76 
 
 
393 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  35.33 
 
 
396 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
386 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
371 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.26 
 
 
403 aa  149  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  28.93 
 
 
370 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  32.06 
 
 
467 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  35.01 
 
 
392 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.32 
 
 
398 aa  141  2e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  32.23 
 
 
405 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  34.12 
 
 
434 aa  140  5e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  31.73 
 
 
397 aa  136  7e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  32.27 
 
 
371 aa  136  7e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  31.34 
 
 
424 aa  135  1e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  32.86 
 
 
374 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  30.95 
 
 
400 aa  129  1e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  30.95 
 
 
400 aa  129  1e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  30.16 
 
 
400 aa  128  2e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  30.18 
 
 
408 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  31.35 
 
 
424 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  25.68 
 
 
372 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  7.9656e-07 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  30.4 
 
 
400 aa  122  1e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  31.02 
 
 
398 aa  122  1e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  31.74 
 
 
387 aa  118  2e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  29.73 
 
 
403 aa  114  4e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  26.15 
 
 
380 aa  113  4e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  33.02 
 
 
377 aa  114  4e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  29.28 
 
 
393 aa  114  4e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  29.51 
 
 
402 aa  113  7e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  30.88 
 
 
351 aa  112  8e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  27.78 
 
 
415 aa  112  8e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  26.21 
 
 
384 aa  110  4e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  27.64 
 
 
415 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  31.5 
 
 
376 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  27.49 
 
 
423 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  32.03 
 
 
408 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  32.55 
 
 
411 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  30.43 
 
 
376 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  28.78 
 
 
376 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  32.75 
 
 
408 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  23.88 
 
 
377 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.46962e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  31.59 
 
 
408 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  27.86 
 
 
364 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.65 
 
 
360 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  27.57 
 
 
364 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  23.6 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  28.16 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  31.64 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  23.29 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  27.86 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  31.68 
 
 
421 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  27.58 
 
 
362 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  23.66 
 
 
377 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  7.57274e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  32.1 
 
 
382 aa  92.8  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  29.33 
 
 
372 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  27.43 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  31.21 
 
 
378 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  33.05 
 
 
382 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  24.93 
 
 
391 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 
388 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.35 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  32.59 
 
 
409 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  31.87 
 
 
408 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.09 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  29.17 
 
 
371 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  30.34 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  30.3 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  29.23 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  31.83 
 
 
369 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  24.72 
 
 
368 aa  85.5  1e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  29.51 
 
 
388 aa  85.9  1e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  30.03 
 
 
397 aa  85.5  2e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  28.04 
 
 
377 aa  85.5  2e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  29.44 
 
 
399 aa  84.7  2e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>