13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1975 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1975  transglutaminase domain protein  100 
 
 
297 aa  580  1e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  2.88031e-06  unclonable  3.94362e-08 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1630  transglutaminase domain protein  47.9 
 
 
324 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0480  hypothetical protein  34.94 
 
 
293 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1017  hypothetical protein  27.65 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3109  hypothetical protein  31.52 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.690645  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0784  transglutaminase domain protein  30.45 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2966  hypothetical protein  30.6 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40905e-05 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2519  transglutaminase domain protein  35.33 
 
 
278 aa  84.7  2e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0270183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0361  transglutaminase domain protein  34.43 
 
 
274 aa  84  3e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.544765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2650  transglutaminase domain protein  29.81 
 
 
306 aa  80.9  2e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0914  hypothetical protein  27.62 
 
 
213 aa  67.8  2e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  41.77 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3251  hypothetical protein  26.77 
 
 
311 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>