More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1973 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  100 
 
 
388 aa  752  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  5.51025e-06  unclonable  4.45037e-08 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  51.16 
 
 
391 aa  346  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  48.96 
 
 
403 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  48.45 
 
 
393 aa  326  4e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  43.19 
 
 
407 aa  321  1e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1213  aminotransferase class V  44.22 
 
 
393 aa  312  5e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  48.97 
 
 
395 aa  311  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  43.04 
 
 
395 aa  307  2e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  2.19699e-09 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  43.44 
 
 
401 aa  305  8e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  47.04 
 
 
393 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4268  class-V aminotransferase  41.98 
 
 
430 aa  282  6e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  39.39 
 
 
394 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  35.7 
 
 
391 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  38.24 
 
 
399 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3537  putative acetyltransferase  35.06 
 
 
413 aa  246  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3189  aminotransferase class V  41.76 
 
 
395 aa  240  3e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8801  aminotransferase class V  39.1 
 
 
413 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1257  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.53 
 
 
403 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  33.84 
 
 
394 aa  175  1e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  33.84 
 
 
394 aa  175  1e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  36.41 
 
 
878 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  32.24 
 
 
393 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  31.89 
 
 
394 aa  170  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1367  aminotransferase  34.13 
 
 
377 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38946  predicted protein  29.69 
 
 
495 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  29.8 
 
 
393 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53750  hypothetical protein  31.2 
 
 
415 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000314396  normal  0.0111206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.05 
 
 
412 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4705  hypothetical protein  30.38 
 
 
415 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.396867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.24 
 
 
406 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  31.63 
 
 
880 aa  149  1e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  32.39 
 
 
896 aa  148  2e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.77 
 
 
885 aa  147  2e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  29.85 
 
 
392 aa  146  7e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  31.63 
 
 
393 aa  146  8e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.72 
 
 
414 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.75 
 
 
418 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  33.07 
 
 
380 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.31 
 
 
404 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.24 
 
 
406 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.3 
 
 
412 aa  142  9e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  32.97 
 
 
408 aa  142  1e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  31.11 
 
 
421 aa  141  2e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.19 
 
 
629 aa  141  2e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  28.91 
 
 
410 aa  141  2e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  29.4 
 
 
414 aa  141  2e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  29.3 
 
 
414 aa  141  2e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  25.62 
 
 
425 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.05 
 
 
413 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  27.55 
 
 
394 aa  139  9e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.58 
 
 
409 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  29.63 
 
 
434 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.8 
 
 
415 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.1 
 
 
409 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  25.46 
 
 
381 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.68 
 
 
414 aa  137  3e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  28.01 
 
 
410 aa  137  3e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.24 
 
 
414 aa  137  3e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.75 
 
 
433 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.77 
 
 
451 aa  136  7e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0198  aminotransferase class V  33.97 
 
 
376 aa  135  1e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.12 
 
 
444 aa  135  1e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  34.66 
 
 
381 aa  135  1e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.55 
 
 
408 aa  134  2e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.05 
 
 
420 aa  135  2e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.3 
 
 
605 aa  134  2e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.56 
 
 
418 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  27.59 
 
 
420 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.82 
 
 
418 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.46 
 
 
404 aa  133  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  32.37 
 
 
383 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.04 
 
 
414 aa  133  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0328  class-V aminotransferase  33.43 
 
 
409 aa  132  1e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.46 
 
 
418 aa  132  1e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  34.97 
 
 
380 aa  132  1e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.64 
 
 
426 aa  131  2e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  24.81 
 
 
420 aa  131  2e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.91 
 
 
410 aa  131  2e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.48 
 
 
413 aa  132  2e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.76 
 
 
407 aa  131  2e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  27.75 
 
 
430 aa  131  2e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  31.43 
 
 
414 aa  131  2e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  27.45 
 
 
405 aa  131  2e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  24.07 
 
 
425 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  24.1 
 
 
416 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.7 
 
 
414 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.3 
 
 
673 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.45 
 
 
406 aa  130  4e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  26.41 
 
 
626 aa  130  5e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.38 
 
 
416 aa  130  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  24.21 
 
 
422 aa  129  7e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  30.99 
 
 
379 aa  129  8e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.98 
 
 
425 aa  129  9e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  27.14 
 
 
416 aa  129  1e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.22 
 
 
413 aa  129  1e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.06 
 
 
664 aa  129  1e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  7.69952e-06 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.27 
 
 
678 aa  129  1e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.67 
 
 
435 aa  128  1e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  28.68 
 
 
879 aa  128  2e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  24.37 
 
 
416 aa  128  2e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>