More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1971 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
393 aa  711  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  3.29191e-07  unclonable  4.14728e-08 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
403 aa  190  3e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  36.9 
 
 
378 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.9 
 
 
370 aa  175  1e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.12 
 
 
394 aa  174  4e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  46.79 
 
 
442 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  39.71 
 
 
442 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  44.19 
 
 
381 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  43.73 
 
 
372 aa  165  2e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.73 
 
 
380 aa  162  8e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  47.96 
 
 
395 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
405 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  39.22 
 
 
380 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  40.39 
 
 
380 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  37.04 
 
 
387 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  38.72 
 
 
417 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  45.96 
 
 
351 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  44.2 
 
 
399 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  34.77 
 
 
405 aa  149  1e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  46.15 
 
 
367 aa  149  1e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  32.96 
 
 
380 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
420 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
388 aa  145  8e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  42.86 
 
 
462 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  32.27 
 
 
433 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  35.57 
 
 
376 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  35.13 
 
 
400 aa  141  2e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  36.16 
 
 
430 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  37.94 
 
 
430 aa  140  4e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  42.44 
 
 
410 aa  140  4e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.5 
 
 
406 aa  139  8e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
496 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  35.16 
 
 
408 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  40.1 
 
 
408 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  36.29 
 
 
478 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  35.01 
 
 
392 aa  137  3e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  44.14 
 
 
428 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 
406 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
441 aa  136  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
382 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  44.12 
 
 
402 aa  135  1e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.15 
 
 
430 aa  134  2e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  36.28 
 
 
422 aa  134  2e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  39.58 
 
 
399 aa  133  4e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  39.47 
 
 
414 aa  132  8e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  41.3 
 
 
399 aa  132  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.97 
 
 
357 aa  132  1e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  38.41 
 
 
376 aa  131  2e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
441 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.92 
 
 
392 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
421 aa  130  6e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  40.8 
 
 
375 aa  129  7e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  44 
 
 
357 aa  129  8e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.56 
 
 
378 aa  127  2e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.85 
 
 
443 aa  128  2e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  38.78 
 
 
388 aa  128  2e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  38.43 
 
 
393 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  38.97 
 
 
413 aa  127  4e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  36.67 
 
 
397 aa  127  4e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9217e-10 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  33.74 
 
 
438 aa  126  8e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
394 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  31.71 
 
 
443 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  33.15 
 
 
402 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  39.74 
 
 
402 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  39.26 
 
 
407 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.89 
 
 
400 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  41.63 
 
 
457 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36940  signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
441 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
398 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  38.39 
 
 
387 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.09 
 
 
424 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  42.35 
 
 
384 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
467 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  41.78 
 
 
449 aa  123  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  4.13704e-05 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  41.06 
 
 
369 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  7.26126e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  38.33 
 
 
434 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.22 
 
 
401 aa  122  1e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  38.33 
 
 
447 aa  122  1e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
424 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  37.55 
 
 
432 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  39.81 
 
 
384 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  42.18 
 
 
470 aa  120  5e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.76 
 
 
422 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  30.71 
 
 
414 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  38.57 
 
 
422 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
500 aa  118  1e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  33.9 
 
 
423 aa  118  1e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
445 aa  118  2e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.51 
 
 
386 aa  118  2e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  37.22 
 
 
439 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
612 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  40.31 
 
 
409 aa  117  4e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
389 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  30.52 
 
 
384 aa  116  8e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  36.78 
 
 
428 aa  115  9e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
379 aa  116  9e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0540  histidine kinase  32.96 
 
 
453 aa  115  1e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231728  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.5 
 
 
383 aa  115  1e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  37.97 
 
 
372 aa  115  2e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
444 aa  114  2e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>