274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1969 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  100 
 
 
329 aa  666  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  1.61701e-07  unclonable  4.10528e-08 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  62.19 
 
 
378 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  59.26 
 
 
357 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  59.63 
 
 
353 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  59.63 
 
 
343 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  59.01 
 
 
349 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  58.51 
 
 
341 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  59.05 
 
 
345 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  58.07 
 
 
349 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  55.73 
 
 
339 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  56.52 
 
 
338 aa  364  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  55.9 
 
 
365 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  57.45 
 
 
355 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  55.93 
 
 
350 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  61.56 
 
 
328 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  56.44 
 
 
345 aa  362  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  56.07 
 
 
360 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  55.32 
 
 
350 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  60.06 
 
 
350 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  54.91 
 
 
351 aa  358  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  56.83 
 
 
356 aa  358  7e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  55.83 
 
 
345 aa  357  2e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  55.52 
 
 
345 aa  356  3e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  55.21 
 
 
354 aa  356  4e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  54.11 
 
 
339 aa  355  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  54.91 
 
 
341 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  54.26 
 
 
328 aa  353  2e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  53.75 
 
 
335 aa  352  3e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  58.63 
 
 
350 aa  353  3e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  54.52 
 
 
346 aa  352  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  54.6 
 
 
346 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  56.07 
 
 
341 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  56.52 
 
 
334 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  54.29 
 
 
341 aa  349  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  57.01 
 
 
375 aa  349  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  53.99 
 
 
341 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  51.56 
 
 
336 aa  347  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  53.96 
 
 
341 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  55.48 
 
 
317 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  55.16 
 
 
317 aa  345  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  53.99 
 
 
682 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  53.99 
 
 
682 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  54.29 
 
 
341 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  55.84 
 
 
315 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  7.31257e-05 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  53.66 
 
 
341 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  55.84 
 
 
315 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  54.37 
 
 
335 aa  343  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  56.31 
 
 
316 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  52.32 
 
 
338 aa  343  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  56.31 
 
 
316 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  52.94 
 
 
347 aa  343  3e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  52.94 
 
 
347 aa  343  3e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  55.52 
 
 
318 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  2.18139e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  51.44 
 
 
335 aa  342  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  56.39 
 
 
315 aa  342  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  53.68 
 
 
341 aa  342  6e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  55.19 
 
 
315 aa  342  6e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  4.97344e-07  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  54.52 
 
 
317 aa  342  6e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  53.35 
 
 
341 aa  341  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  53.35 
 
 
341 aa  341  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  56.07 
 
 
315 aa  340  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  53.12 
 
 
343 aa  340  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  53.35 
 
 
341 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  53.35 
 
 
341 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  53.35 
 
 
341 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  53.35 
 
 
341 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  55.42 
 
 
339 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  50 
 
 
335 aa  337  2e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  52.34 
 
 
361 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  46.73 
 
 
332 aa  329  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  48.75 
 
 
335 aa  326  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  45.68 
 
 
330 aa  326  3e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  50.32 
 
 
336 aa  324  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  46.73 
 
 
338 aa  323  3e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  51.08 
 
 
341 aa  322  8e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  50.31 
 
 
341 aa  321  1e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  49.84 
 
 
337 aa  316  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  47.35 
 
 
343 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  47.68 
 
 
341 aa  301  7e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  49.85 
 
 
333 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  46.5 
 
 
344 aa  296  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  45.23 
 
 
348 aa  293  2e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  9.46947e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  48.36 
 
 
342 aa  286  4e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59156  adenine aminohydrolase (adenine deaminase)  45.4 
 
 
355 aa  284  1e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0307453 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  44.79 
 
 
338 aa  278  8e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  45.31 
 
 
337 aa  272  4e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  42.15 
 
 
346 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06078  Adenosine deaminase (EC 3.5.4.4)(Adenosine aminohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8X1T6]  40.36 
 
 
364 aa  255  6e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140027  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  40.43 
 
 
337 aa  243  2e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  40.18 
 
 
340 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  39.88 
 
 
340 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  36.84 
 
 
346 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  40.85 
 
 
352 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  36.84 
 
 
366 aa  201  1e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl215  adenosine deaminase  34.05 
 
 
334 aa  201  1e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  38.36 
 
 
368 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  36.2 
 
 
337 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  35.48 
 
 
353 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  33.75 
 
 
346 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  39.09 
 
 
366 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>