More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1937 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1937  peroxiredoxin, Ohr subfamily  100 
 
 
142 aa  287  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  61.94 
 
 
140 aa  167  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  61.94 
 
 
140 aa  167  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  61.94 
 
 
140 aa  167  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  60.74 
 
 
141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0013  OsmC family protein  58.21 
 
 
142 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1525  OsmC family protein  60.45 
 
 
141 aa  157  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.267191  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5326  OsmC family protein  56.72 
 
 
142 aa  154  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2752  peroxiredoxin, Ohr subfamily  55.88 
 
 
141 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0652755  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  55.15 
 
 
142 aa  150  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  56.3 
 
 
141 aa  150  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0028  OsmC-like protein  52.55 
 
 
142 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.477664  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1208  OsmC family protein  55.22 
 
 
143 aa  147  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000524524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  58.21 
 
 
147 aa  147  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3323  OsmC family protein  55.81 
 
 
142 aa  147  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800785  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0223  OsmC family protein  55.15 
 
 
140 aa  147  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  54.74 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  56.93 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0334  OsmC family protein  51.85 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06210  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  53.68 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1150  OsmC family protein  55.15 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.283735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  58.52 
 
 
138 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3790  peroxiredoxin, Ohr subfamily  57.97 
 
 
145 aa  145  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1135  OsmC family protein  52.99 
 
 
143 aa  144  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  52.59 
 
 
142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  53.73 
 
 
142 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  52.24 
 
 
139 aa  141  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0809374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  52.59 
 
 
141 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0482  OsmC family protein  56.3 
 
 
138 aa  140  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0376835 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0473  OsmC family protein  56.3 
 
 
138 aa  140  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  53.28 
 
 
140 aa  141  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21080  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  53.85 
 
 
142 aa  140  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1307  OsmC family protein  52.55 
 
 
138 aa  140  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4559  organic hydroperoxide resistance protein  51.45 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4365  organic hydroperoxide resistance protein  51.45 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4201  organic hydroperoxide resistance protein  51.45 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.675876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4212  organic hydroperoxide resistance protein  51.45 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.600426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4555  organic hydroperoxide resistance protein  51.45 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4700  organic hydroperoxide resistance protein  51.45 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4586  organic hydroperoxide resistance protein  51.45 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4604  organic hydroperoxide resistance protein  52.59 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0390709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4313  OsmC family protein  51.45 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  55.22 
 
 
141 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09146  organic hydroperoxide resistance protein  50 
 
 
141 aa  138  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.851142  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  46.81 
 
 
141 aa  138  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0648  organic hydroperoxide resistance protein  50.72 
 
 
138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  54.07 
 
 
142 aa  137  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  53.28 
 
 
141 aa  137  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  54.14 
 
 
142 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  51.43 
 
 
141 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  51.49 
 
 
141 aa  136  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  54.89 
 
 
142 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  51.85 
 
 
141 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0778  OsmC family protein  54.14 
 
 
137 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231351  normal  0.206875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  54.14 
 
 
142 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  51.45 
 
 
140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  51.11 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  53.03 
 
 
140 aa  134  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0476  OsmC-like protein  51.8 
 
 
190 aa  133  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  50 
 
 
140 aa  133  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  51.85 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  48.89 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  51.11 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  49.63 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  48.89 
 
 
141 aa  131  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  51.13 
 
 
139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  48.15 
 
 
141 aa  130  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  50.36 
 
 
139 aa  130  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  50.36 
 
 
140 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0338  OsmC family protein  53.33 
 
 
144 aa  130  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  50.37 
 
 
141 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  50.37 
 
 
139 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  51.88 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0446  OsmC-like protein protein  50.36 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.379428  normal  0.212625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0240  OsmC family protein  51.45 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1195  OsmC family protein  55.56 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4967  OsmC family protein  52.55 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  48.53 
 
 
141 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3098  OsmC family protein  48.53 
 
 
141 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  49.64 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  49.64 
 
 
140 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  50 
 
 
142 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  48.55 
 
 
140 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5175  OsmC family protein  64.21 
 
 
115 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  48.18 
 
 
141 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  48.53 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3597  OsmC family protein  51.49 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000950914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  50.36 
 
 
141 aa  124  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  51.8 
 
 
141 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0933  OsmC family protein  52.86 
 
 
141 aa  124  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.015956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  51.82 
 
 
142 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4882  OsmC-like protein  47.01 
 
 
139 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000261871  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0833  peroxiredoxin, Ohr subfamily  48.55 
 
 
147 aa  123  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4744  OsmC family protein  48.18 
 
 
140 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3667  OsmC family protein  48.18 
 
 
140 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.517733  normal  0.661617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2792  OsmC family protein  52.27 
 
 
142 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000166944  hitchhiker  0.0000110677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1223  OsmC-like protein  46.27 
 
 
139 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20817  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  45.19 
 
 
141 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1702  OsmC family protein  46.27 
 
 
139 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4973  OsmC family protein  44.37 
 
 
142 aa  121  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>