108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1848 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  100 
 
 
301 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  77.81 
 
 
302 aa  481  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  55.52 
 
 
284 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  53.56 
 
 
316 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  52.8 
 
 
292 aa  299  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  55.66 
 
 
308 aa  298  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  55.51 
 
 
289 aa  292  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  48.85 
 
 
286 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  42.7 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  39.67 
 
 
290 aa  212  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  47.11 
 
 
297 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  45.35 
 
 
275 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  39.14 
 
 
290 aa  209  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  46.18 
 
 
274 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  45.78 
 
 
274 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  44.83 
 
 
270 aa  203  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  42.54 
 
 
285 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  42.54 
 
 
285 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  42.16 
 
 
285 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  42.16 
 
 
285 aa  192  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  41.94 
 
 
303 aa  188  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  41.67 
 
 
295 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  37.98 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  37.74 
 
 
308 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  38.21 
 
 
284 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  38.21 
 
 
287 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  37.74 
 
 
284 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  37.74 
 
 
284 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  37.74 
 
 
287 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  35.02 
 
 
291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  32.08 
 
 
310 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  39.09 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  31.46 
 
 
324 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  36.1 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  33.07 
 
 
294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  31.64 
 
 
290 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  37.07 
 
 
421 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  34.62 
 
 
326 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  37.25 
 
 
298 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000123231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  30 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  30.35 
 
 
292 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  29.69 
 
 
292 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  29.69 
 
 
292 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  29.69 
 
 
292 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  29.69 
 
 
292 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  31.25 
 
 
290 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000198818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  37.56 
 
 
297 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  34.01 
 
 
224 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  30.38 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2783  manganese containing catalase  37.5 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00681002  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  32.68 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  32.68 
 
 
298 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  35.78 
 
 
298 aa  119  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0584316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  31.94 
 
 
249 aa  119  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  32.55 
 
 
298 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  34.95 
 
 
291 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  30.71 
 
 
304 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  30.71 
 
 
304 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  33.98 
 
 
205 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  31.05 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  30.71 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3157  Mn-containing catalase  36.72 
 
 
249 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117641  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  33.8 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  31.87 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  31.46 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  35.47 
 
 
302 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  31.8 
 
 
300 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3115  manganese containing catalase  34.5 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  34.85 
 
 
293 aa  109  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  28.12 
 
 
303 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5727  manganese containing catalase  34.16 
 
 
304 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.388852  hitchhiker  0.00719162 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5945  manganese containing catalase  32.73 
 
 
304 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995052  normal  0.0254671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  32.83 
 
 
231 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000426374  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4224  manganese containing catalase  32.55 
 
 
307 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0292992  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4594  manganese containing catalase  32.08 
 
 
307 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.756991  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  32.08 
 
 
307 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5292  manganese containing catalase  33.17 
 
 
304 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0651334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  32.99 
 
 
228 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  0.00000000343768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  30.65 
 
 
227 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  28.84 
 
 
245 aa  96.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  31.28 
 
 
188 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  31.28 
 
 
188 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  34.07 
 
 
190 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  29.84 
 
 
230 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  30.77 
 
 
189 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  31.63 
 
 
189 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  31.63 
 
 
189 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000660321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  31.12 
 
 
189 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  31.12 
 
 
189 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000213334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  31.12 
 
 
189 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  31.12 
 
 
189 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  31.12 
 
 
189 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000303709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  31.12 
 
 
189 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000621736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  31.12 
 
 
189 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000889969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  31.12 
 
 
189 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  31.12 
 
 
189 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  28.21 
 
 
203 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  30.1 
 
 
189 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0232  Catalase  29.9 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  29.8 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>