136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1796 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  100 
 
 
847 aa  1626    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  31.36 
 
 
934 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  33.14 
 
 
713 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  29.14 
 
 
801 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.29 
 
 
1262 aa  170  9e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  30.91 
 
 
1056 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25.28 
 
 
1050 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  28.04 
 
 
963 aa  154  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  22.73 
 
 
1125 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  23.92 
 
 
1185 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  31.4 
 
 
828 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  24.3 
 
 
1128 aa  138  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 
837 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.12 
 
 
1288 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.21 
 
 
1131 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  28.24 
 
 
1068 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  22.09 
 
 
1039 aa  121  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  31.76 
 
 
829 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.56 
 
 
1424 aa  115  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
785 aa  111  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  26.96 
 
 
1523 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 
776 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  25.55 
 
 
577 aa  108  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  30.24 
 
 
897 aa  107  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.31 
 
 
1088 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  25.94 
 
 
1314 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  28.61 
 
 
849 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
911 aa  104  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  25.96 
 
 
845 aa  104  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
1105 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  21.76 
 
 
1146 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
1283 aa  101  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  29.63 
 
 
859 aa  99.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  26.66 
 
 
1509 aa  99  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  25.23 
 
 
1500 aa  97.8  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  22.53 
 
 
1136 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
949 aa  97.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  26.67 
 
 
1324 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  27.69 
 
 
1000 aa  96.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  30.16 
 
 
899 aa  95.9  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
454 aa  94.7  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  29.04 
 
 
900 aa  94.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 
857 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 
814 aa  91.3  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  36.17 
 
 
702 aa  87.8  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  28.42 
 
 
992 aa  87.4  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  26.42 
 
 
1488 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  24.69 
 
 
843 aa  86.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.85 
 
 
1040 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  46.85 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
924 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
751 aa  82.4  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  22.54 
 
 
825 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  30.91 
 
 
675 aa  79  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  30.59 
 
 
1468 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  23.76 
 
 
526 aa  76.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.03 
 
 
767 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  26.13 
 
 
1383 aa  75.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  25.1 
 
 
838 aa  75.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  26.94 
 
 
958 aa  75.1  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.76 
 
 
568 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 
1290 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
568 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.63 
 
 
1328 aa  71.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20.59 
 
 
1404 aa  71.2  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  28.35 
 
 
1010 aa  70.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  35.71 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  30.14 
 
 
1261 aa  70.5  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  27.39 
 
 
965 aa  70.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 
991 aa  69.3  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 
1186 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  20.55 
 
 
822 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  24.44 
 
 
793 aa  68.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.32 
 
 
841 aa  67.8  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  25.89 
 
 
1311 aa  67.8  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  21.1 
 
 
672 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 
843 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  24.22 
 
 
1475 aa  63.9  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  26.5 
 
 
1309 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 
953 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1215 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.76 
 
 
1228 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2673  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
540 aa  62  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0573698  normal  0.794147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3751  ATP/GTP-binding protein  28.02 
 
 
702 aa  61.6  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2833  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
344 aa  61.6  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.922484  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.09 
 
 
694 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  31.63 
 
 
1326 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
284 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1407  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
248 aa  58.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  29.38 
 
 
969 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
531 aa  56.2  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  24.48 
 
 
362 aa  56.2  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  22.41 
 
 
977 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  23.32 
 
 
919 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.28 
 
 
885 aa  56.2  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  22.27 
 
 
1044 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  27.63 
 
 
757 aa  54.3  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
481 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 
640 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 
304 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>