73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1786 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 181 aa  240  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  29.88 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  27.98 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  28.81 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  33.12 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  25.61 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  31.01 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  30.38 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  29.81 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  37.97 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 121 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  32.09 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  26.62 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  30.95 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  27.68 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  37.18 
 
 		 252 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  28.24 
 
 		 206 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  26.47 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  26.32 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  28.83 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  17.47 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  19.28 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  33.78 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  29.24 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  23.3 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  28 
 
 		 155 aa  44.7  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  28.36 
 
 		 222 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  27.63 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  17.47 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 109 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  36.67 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  25.15 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  38.03 
 
 		 263 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  27.21 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 334 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  38.36 
 
 		 197 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 152 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 187 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  38.96 
 
 		 123 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 240 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3009  transcriptional regulator, PadR-like  38.36 
 
 		 141 aa  41.2  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  33.78 
 
 		 109 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 206 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 181 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>