More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1765 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1765  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 514 aa  1006    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459624  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3763  benzoate-coenzyme A ligase  54.53 
 
 		 522 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0336097  normal  0.403317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12962  acyl-CoA synthetase  40.79 
 
 		 705 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  35.15 
 
 		 532 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  37.12 
 
 		 527 aa  276  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  37.83 
 
 		 521 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  36.15 
 
 		 528 aa  273  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  37.16 
 
 		 531 aa  270  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3554  AMP-dependent synthetase and ligase  43.18 
 
 		 503 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.144177  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  36.13 
 
 		 530 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  36.29 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  36.7 
 
 		 524 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  35.55 
 
 		 530 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  36.56 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  35.85 
 
 		 524 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  36.78 
 
 		 526 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  35.1 
 
 		 503 aa  256  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  35.15 
 
 		 524 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  34.95 
 
 		 528 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  34.48 
 
 		 533 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  34.29 
 
 		 531 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  37.12 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 506 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  36.04 
 
 		 550 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  33.89 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  35.25 
 
 		 549 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  36.26 
 
 		 515 aa  246  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  34.95 
 
 		 518 aa  246  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  34.35 
 
 		 523 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1526  benzoate-CoA ligase family  34.73 
 
 		 520 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  35.21 
 
 		 527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  34.38 
 
 		 535 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  35.43 
 
 		 553 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  34.44 
 
 		 513 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  30.1 
 
 		 525 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  32.92 
 
 		 521 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  35.17 
 
 		 518 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  34.01 
 
 		 517 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 537 aa  236  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  33.46 
 
 		 519 aa  235  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0736  benzoate-CoA ligase family  34.38 
 
 		 539 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  34.86 
 
 		 554 aa  230  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3360  benzoate-CoA ligase family  34.22 
 
 		 505 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2116  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.528716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 529 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 		 662 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 542 aa  217  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.29536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  33.6 
 
 		 512 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  32.28 
 
 		 541 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 545 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 543 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2688  putative acid-thiol ligase  30.78 
 
 		 567 aa  210  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.135272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0589  benzoate-CoA ligase family  30.75 
 
 		 547 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4402  coenzyme A ligase  33.94 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 546 aa  203  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 		 490 aa  203  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 553 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 507 aa  199  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 		 548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  31.85 
 
 		 541 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5042  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 542 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 549 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 546 aa  197  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51430  coenzyme A ligase  33.19 
 
 		 517 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261985 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 512 aa  196  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 546 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 585 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5524  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 557 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 507 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  31.64 
 
 		 541 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  31.58 
 
 		 546 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.27 
 
 		 519 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 495 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  31.64 
 
 		 541 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 492 aa  195  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.28 
 
 		 513 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.89 
 
 		 526 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1530  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 522 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910104 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 504 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 544 aa  193  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4971  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 556 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 546 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 511 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.89 
 
 		 510 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.03 
 
 		 524 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3949  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 538 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 538 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.464293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.69 
 
 		 510 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.3 
 
 		 514 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 536 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  33.94 
 
 		 570 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.5 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.12 
 
 		 510 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  33.74 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.69 
 
 		 510 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  33.74 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  33.74 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>