41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1747 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 280 aa  569  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  33.85 
 
 		 699 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  33.85 
 
 		 704 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  33.46 
 
 		 704 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  33.08 
 
 		 705 aa  118  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  33.08 
 
 		 699 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  33.08 
 
 		 699 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  33.08 
 
 		 699 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  31.92 
 
 		 704 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  33.21 
 
 		 933 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  31.92 
 
 		 704 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  32.06 
 
 		 726 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  29.23 
 
 		 701 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  31.95 
 
 		 709 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  30.97 
 
 		 700 aa  99.4  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  30.92 
 
 		 702 aa  98.6  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  32.58 
 
 		 727 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  31.15 
 
 		 701 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  28.19 
 
 		 709 aa  97.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  31.3 
 
 		 702 aa  97.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  31.3 
 
 		 702 aa  97.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  32.31 
 
 		 553 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 252 aa  96.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  29.07 
 
 		 716 aa  92.4  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  30.23 
 
 		 722 aa  92.4  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  30 
 
 		 701 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  27.8 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  23.01 
 
 		 747 aa  72.4  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  30.39 
 
 		 703 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33230  predicted protein  28.3 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0061924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  24.42 
 
 		 696 aa  62.8  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 326 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000694  hypothetical protein  28.18 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  26.85 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  29.17 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.26 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>