More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1616 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  64.65 
 
 		 216 aa  235  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  44.28 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  44.17 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 383 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  42.44 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  37.7 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 185 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 210 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  35.32 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.84 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  32.67 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 194 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  34.12 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  30.69 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  34.38 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  36.81 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  29 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  30.73 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5770  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  29.85 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>