More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1613 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  75.51 
 
 		 491 aa  709    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 527 aa  1019    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  75 
 
 		 494 aa  701    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  72.53 
 
 		 495 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  73.93 
 
 		 476 aa  674    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  74.9 
 
 		 490 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  69.94 
 
 		 498 aa  624  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  63.54 
 
 		 501 aa  532  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  56.74 
 
 		 529 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  60.16 
 
 		 511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  61.48 
 
 		 501 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  59.22 
 
 		 509 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  59.02 
 
 		 486 aa  505  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  57.82 
 
 		 575 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  57.17 
 
 		 512 aa  488  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  57.46 
 
 		 521 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  58.8 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  55.05 
 
 		 507 aa  468  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  55.11 
 
 		 509 aa  465  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  54.48 
 
 		 520 aa  452  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  55.88 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  50.49 
 
 		 517 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  54.75 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  54.75 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  54.75 
 
 		 495 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  54.58 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  50.1 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  43.56 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  43.37 
 
 		 513 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  43.56 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  43.17 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  43.17 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0323  cobyric acid synthase  47.87 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  49.08 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  48.68 
 
 		 490 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  48.39 
 
 		 496 aa  361  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  48.56 
 
 		 481 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  48.56 
 
 		 481 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  41.87 
 
 		 517 aa  359  8e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  45.55 
 
 		 489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  46.86 
 
 		 495 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  39.45 
 
 		 514 aa  356  5e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  46.33 
 
 		 484 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  46.39 
 
 		 487 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  48.04 
 
 		 485 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.97 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  43.62 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  46.01 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  48.98 
 
 		 481 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.36 
 
 		 485 aa  349  6e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  48.04 
 
 		 477 aa  349  9e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  43.03 
 
 		 498 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  36.97 
 
 		 494 aa  347  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  45.77 
 
 		 481 aa  347  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  42.12 
 
 		 485 aa  347  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  42.41 
 
 		 475 aa  347  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  45.36 
 
 		 484 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  42.55 
 
 		 508 aa  346  7e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  44.03 
 
 		 485 aa  346  8e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  45.88 
 
 		 483 aa  345  8.999999999999999e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  46.53 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  45.59 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  42.45 
 
 		 491 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  44.95 
 
 		 484 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  42.83 
 
 		 797 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  44.89 
 
 		 488 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  44.44 
 
 		 480 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  45.27 
 
 		 506 aa  342  8e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  44.47 
 
 		 484 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  42.74 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  45.87 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  41.68 
 
 		 772 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  42.06 
 
 		 776 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  43.93 
 
 		 487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  44.49 
 
 		 494 aa  340  5e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  45.85 
 
 		 505 aa  339  7e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  37.92 
 
 		 501 aa  339  7e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.56 
 
 		 503 aa  339  8e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  40.08 
 
 		 500 aa  339  9e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  37.9 
 
 		 507 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  43.52 
 
 		 852 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  42.32 
 
 		 505 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  45.38 
 
 		 518 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0789  cobyric acid synthase  48.16 
 
 		 494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00846074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  41.02 
 
 		 787 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  42.05 
 
 		 503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  39.76 
 
 		 506 aa  336  5e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  39.36 
 
 		 503 aa  336  7.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  40.86 
 
 		 536 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  46.28 
 
 		 510 aa  335  9e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  41.63 
 
 		 858 aa  335  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  41 
 
 		 491 aa  334  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2146  cobyric acid synthase CobQ  42.8 
 
 		 485 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363664  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  42.01 
 
 		 495 aa  335  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  42.45 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4778  cobyric acid synthase CobQ  47.39 
 
 		 628 aa  334  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.316992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  45.88 
 
 		 500 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  43.71 
 
 		 539 aa  333  6e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  41.06 
 
 		 864 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3178  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  47.07 
 
 		 493 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.954428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>