72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1584 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
211 aa  418  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  47.73 
 
 
220 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  46.15 
 
 
230 aa  167  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  42.04 
 
 
223 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 
234 aa  119  4e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 
229 aa  115  7e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  35.42 
 
 
236 aa  115  7e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  36.02 
 
 
236 aa  114  1e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  36.02 
 
 
236 aa  114  1e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  36.44 
 
 
236 aa  110  2e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 
232 aa  109  4e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  36.48 
 
 
288 aa  107  9e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 
236 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  34.75 
 
 
236 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.9 
 
 
236 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
224 aa  104  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
231 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  33.76 
 
 
238 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.05 
 
 
236 aa  101  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 
235 aa  101  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
244 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.8 
 
 
224 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  36.57 
 
 
224 aa  99  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  35 
 
 
236 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.67 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  37.67 
 
 
224 aa  93.2  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 
227 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  33.48 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 
222 aa  92  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  34.06 
 
 
236 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 
250 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 
222 aa  89  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  29.66 
 
 
236 aa  88.2  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  32.19 
 
 
229 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  32.19 
 
 
229 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 
225 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  32.19 
 
 
229 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  32.19 
 
 
229 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  32.19 
 
 
229 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  32.19 
 
 
229 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  32.19 
 
 
229 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
224 aa  83.2  3e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
218 aa  82  5e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 
225 aa  80.9  1e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
224 aa  81.3  1e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
224 aa  81.3  1e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
224 aa  76.6  2e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  27.38 
 
 
271 aa  62.4  4e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.64 
 
 
222 aa  60.1  3e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  27.52 
 
 
209 aa  54.3  1e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
203 aa  51.2  1e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 
203 aa  50.4  2e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 
203 aa  50.4  2e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 
203 aa  50.4  2e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 
209 aa  50.1  3e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 
258 aa  48.5  7e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.89 
 
 
162 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  22.92 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  35.94 
 
 
165 aa  42.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3237  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.879445  normal  0.545559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  27.46 
 
 
202 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0582  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.62 
 
 
146 aa  42  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.016347  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  28.65 
 
 
232 aa  41.6  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>