265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1501 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  65.19 
 
 		 675 aa  781    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  100 
 
 		 683 aa  1344    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  34.75 
 
 		 663 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 331 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  53.42 
 
 		 318 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  35.13 
 
 		 663 aa  281  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  45.31 
 
 		 361 aa  263  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  51.26 
 
 		 313 aa  259  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  47.37 
 
 		 318 aa  250  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  48.51 
 
 		 319 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  48.17 
 
 		 315 aa  243  9e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  46.5 
 
 		 352 aa  241  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  48.38 
 
 		 327 aa  240  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  47.4 
 
 		 330 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  46.77 
 
 		 335 aa  236  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  42.69 
 
 		 361 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  45.76 
 
 		 327 aa  226  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  43.03 
 
 		 364 aa  226  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  44.55 
 
 		 327 aa  226  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  43.75 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  47.85 
 
 		 330 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  43.15 
 
 		 359 aa  221  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  43.12 
 
 		 326 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  43.12 
 
 		 326 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  43.12 
 
 		 326 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  43.29 
 
 		 323 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  40.91 
 
 		 332 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  41.37 
 
 		 335 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  42.37 
 
 		 344 aa  213  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  42.9 
 
 		 325 aa  204  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  42.64 
 
 		 323 aa  204  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  45.51 
 
 		 327 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  42.15 
 
 		 331 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  42.51 
 
 		 326 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  41.12 
 
 		 321 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  41.06 
 
 		 401 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  36.53 
 
 		 361 aa  181  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  38.12 
 
 		 337 aa  180  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  42.39 
 
 		 331 aa  178  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  38.8 
 
 		 320 aa  177  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  39.26 
 
 		 325 aa  175  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  39.62 
 
 		 337 aa  173  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  39.6 
 
 		 340 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  38.89 
 
 		 321 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  36.45 
 
 		 354 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  37.96 
 
 		 317 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  35.65 
 
 		 343 aa  160  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  40.81 
 
 		 348 aa  160  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  39.94 
 
 		 336 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  34.23 
 
 		 334 aa  151  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  35.92 
 
 		 330 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  34.52 
 
 		 326 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  36.81 
 
 		 326 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  31.34 
 
 		 664 aa  138  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  31.58 
 
 		 325 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  31.58 
 
 		 325 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  31.58 
 
 		 325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  34.63 
 
 		 341 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  32.52 
 
 		 331 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  31.68 
 
 		 328 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  41.06 
 
 		 334 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  27.72 
 
 		 687 aa  120  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  34.64 
 
 		 324 aa  118  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  30.13 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  30.1 
 
 		 699 aa  100  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 328 aa  99.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 369 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.97 
 
 		 336 aa  89  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  28.53 
 
 		 327 aa  88.2  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.71 
 
 		 347 aa  87  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  27.91 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  29.05 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 313 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  30.47 
 
 		 368 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  26.91 
 
 		 313 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.92 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  27.3 
 
 		 512 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  26.16 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.74 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  30.03 
 
 		 369 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.19 
 
 		 316 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  29.72 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.2 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  30.03 
 
 		 367 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.9 
 
 		 228 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.47 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  29.33 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  29.51 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  25 
 
 		 339 aa  67  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  31.47 
 
 		 228 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.47 
 
 		 228 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.75 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.12 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.19 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.19 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.58 
 
 		 317 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>