39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1492 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
384 aa  765    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  72.54 
 
 
381 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  51.27 
 
 
381 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  45.36 
 
 
374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  49.26 
 
 
368 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  41.33 
 
 
500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.01 
 
 
378 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  42.32 
 
 
503 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.35 
 
 
372 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  41.56 
 
 
499 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  47.23 
 
 
501 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  43.27 
 
 
522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  41.87 
 
 
507 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  42.29 
 
 
500 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.27 
 
 
494 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.49 
 
 
457 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  38.85 
 
 
399 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  42.77 
 
 
496 aa  212  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  39.88 
 
 
488 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  37.95 
 
 
522 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.77 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4297  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.05 
 
 
368 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  39.38 
 
 
344 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  37.46 
 
 
349 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  38.08 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.99 
 
 
387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.07 
 
 
220 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  33.95 
 
 
366 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  34.17 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.05 
 
 
800 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1075  hypothetical protein  26.42 
 
 
419 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000439161  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2208  hypothetical protein  27 
 
 
430 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000512489  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3056  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.85 
 
 
696 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  28.96 
 
 
823 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.12 
 
 
222 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6012  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4484  S1E family peptidase  32.14 
 
 
136 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0979006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  26.37 
 
 
261 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0421  hypothetical protein  29.25 
 
 
214 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>