More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1491 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  82.09 
 
 
539 aa  886    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  100 
 
 
537 aa  1072    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  73 
 
 
538 aa  769    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  38.95 
 
 
556 aa  327  5e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  34.92 
 
 
546 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  35.1 
 
 
545 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  35.35 
 
 
549 aa  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.59 
 
 
539 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  33.52 
 
 
584 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  33.4 
 
 
543 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  30.6 
 
 
564 aa  241  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  36.54 
 
 
548 aa  239  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  34.02 
 
 
541 aa  233  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.42 
 
 
557 aa  233  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  32.04 
 
 
583 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  32.45 
 
 
543 aa  232  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.58 
 
 
532 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  33.78 
 
 
530 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  34.18 
 
 
543 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.75 
 
 
553 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  31.99 
 
 
601 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  34.85 
 
 
541 aa  209  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  33.15 
 
 
548 aa  208  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
536 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
536 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
536 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.89 
 
 
556 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.76 
 
 
520 aa  206  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.87 
 
 
543 aa  204  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.7 
 
 
556 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  32.26 
 
 
625 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  32.6 
 
 
530 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  33.04 
 
 
539 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.53 
 
 
575 aa  195  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  27.62 
 
 
604 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  31.88 
 
 
537 aa  194  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.35 
 
 
575 aa  193  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  32.78 
 
 
535 aa  191  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  28.46 
 
 
533 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  32.54 
 
 
537 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  34.07 
 
 
522 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  30.98 
 
 
564 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  33.73 
 
 
525 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  28.34 
 
 
601 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  27.54 
 
 
574 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  27.57 
 
 
563 aa  187  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.85 
 
 
520 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  31.44 
 
 
564 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.59 
 
 
549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  28.62 
 
 
539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  27.36 
 
 
522 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.25 
 
 
560 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.55 
 
 
540 aa  183  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  31.17 
 
 
533 aa  183  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 
586 aa  183  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  29.97 
 
 
562 aa  182  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  26.99 
 
 
522 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  28.9 
 
 
581 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  26.99 
 
 
522 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  26.65 
 
 
522 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  26.99 
 
 
522 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  26.8 
 
 
522 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  26.64 
 
 
522 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  28.44 
 
 
606 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.25 
 
 
565 aa  179  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.63 
 
 
579 aa  179  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  30.54 
 
 
620 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.29 
 
 
546 aa  178  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.22 
 
 
527 aa  177  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  27.04 
 
 
592 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  26.36 
 
 
522 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  33.15 
 
 
536 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  27.04 
 
 
522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.09 
 
 
543 aa  174  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  27 
 
 
522 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  28.83 
 
 
603 aa  172  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  32.07 
 
 
547 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.65 
 
 
583 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  29.85 
 
 
573 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  29.31 
 
 
583 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  29.31 
 
 
583 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  29.36 
 
 
543 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  32.97 
 
 
555 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.98 
 
 
569 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  33.09 
 
 
565 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.48 
 
 
542 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  28.16 
 
 
587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  32.24 
 
 
555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  29.89 
 
 
560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  25.39 
 
 
582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  33.89 
 
 
536 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  30.8 
 
 
590 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.64 
 
 
540 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  29.14 
 
 
542 aa  162  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  29.62 
 
 
543 aa  161  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.59 
 
 
544 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.48 
 
 
544 aa  159  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  27.03 
 
 
608 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  29.76 
 
 
512 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  27.85 
 
 
563 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>