262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1467 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  100 
 
 		 463 aa  914    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  36.7 
 
 		 479 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  42.6 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  38.79 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  36.66 
 
 		 466 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  31.66 
 
 		 495 aa  227  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  31.44 
 
 		 495 aa  223  6e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  32.21 
 
 		 470 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  38.07 
 
 		 427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  32.21 
 
 		 468 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  30 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  29.29 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  31.83 
 
 		 628 aa  169  8e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  29.65 
 
 		 481 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  33.2 
 
 		 1199 aa  156  7e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  30.6 
 
 		 418 aa  153  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  33.06 
 
 		 1274 aa  133  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  30.04 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  29.58 
 
 		 413 aa  127  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  29 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  31.11 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  31.2 
 
 		 417 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  24.18 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  27.27 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  26.72 
 
 		 657 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  28.09 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  27.85 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  29.39 
 
 		 999 aa  101  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  29.93 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  27.05 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  29.78 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  24.54 
 
 		 494 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  29.18 
 
 		 442 aa  100  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  28.94 
 
 		 442 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  25.55 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  32.53 
 
 		 439 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  29.82 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  27.52 
 
 		 425 aa  94  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  27.17 
 
 		 451 aa  93.6  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  27.08 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  25.78 
 
 		 422 aa  91.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  23.03 
 
 		 577 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  24.33 
 
 		 422 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  25.21 
 
 		 484 aa  89.7  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  33.1 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  27.21 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  27.36 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  27.01 
 
 		 485 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  26.35 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  26 
 
 		 484 aa  87.4  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  34.26 
 
 		 413 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  28.34 
 
 		 450 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  27.49 
 
 		 465 aa  86.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  32.64 
 
 		 446 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  26.96 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  25.41 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  27.99 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  25.18 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  26.14 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  32.65 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  27.47 
 
 		 427 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  23.59 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  28.54 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  22.76 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  25.98 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  25.75 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  22.45 
 
 		 482 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  22.45 
 
 		 482 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  22.45 
 
 		 487 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  27.76 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  22.93 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  22.41 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  23.42 
 
 		 592 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  22.66 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  27.14 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  26.26 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1593  amine oxidase  31.77 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  26.16 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.32 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  22.98 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.57 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25.74 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  22.27 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  21.21 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  21.21 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  29.37 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  24.45 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  26.75 
 
 		 496 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  28.32 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  25.05 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  26.91 
 
 		 625 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  22.53 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  28.77 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  27.04 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.61 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  23.92 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  21.91 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  28.42 
 
 		 600 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  26.61 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  26.51 
 
 		 624 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>