More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1429 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0107  isocitrate lyase  77.35 
 
 
428 aa  689    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19864  normal  0.815219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0763  isocitrate lyase  72.47 
 
 
431 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0768  isocitrate lyase  72.9 
 
 
431 aa  637    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.139053  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2486  isocitrate lyase  69.88 
 
 
434 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  hitchhiker  0.000410073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0073  isocitrate lyase  73.98 
 
 
452 aa  645    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.136709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  83.37 
 
 
430 aa  747    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0649  isocitrate lyase  77.83 
 
 
428 aa  690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.966467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2006  isocitrate lyase  81.07 
 
 
422 aa  715    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249594  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1377  isocitrate lyase  87.18 
 
 
429 aa  797    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1961  isocitrate lyase  70.92 
 
 
431 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28360  isocitrate lyase  80.94 
 
 
432 aa  737    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.721222  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02080  isocitrate lyase  77.33 
 
 
435 aa  694    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1429  isocitrate lyase  100 
 
 
432 aa  894    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0711  isocitrate lyase  77.91 
 
 
438 aa  684    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1009  isocitrate lyase  72.12 
 
 
429 aa  635    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3449  putative isocitrate lyase  85.01 
 
 
430 aa  769    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0890897  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3668  isocitrate lyase  75.24 
 
 
430 aa  681    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1651  isocitrate lyase  69.88 
 
 
434 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232298  normal  0.0282677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5339  isocitrate lyase  75.89 
 
 
434 aa  671    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641563  normal  0.832749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0801  isocitrate lyase  77.83 
 
 
428 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619392  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2490  isocitrate lyase  79.58 
 
 
429 aa  727    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000238202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1385  isocitrate lyase  71.63 
 
 
431 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0629  isocitrate lyase  77.83 
 
 
428 aa  690    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10474  isocitrate lyase icl  77.83 
 
 
428 aa  689    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0636  isocitrate lyase  77.83 
 
 
428 aa  690    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0923  isocitrate lyase  75.31 
 
 
442 aa  643    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0583  isocitrate lyase  76.02 
 
 
443 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  69.01 
 
 
434 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1358  isocitrate lyase  69.43 
 
 
443 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.355427  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  70.88 
 
 
428 aa  628  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5357  isocitrate lyase  69.4 
 
 
435 aa  627  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1950  isocitrate lyase  69.16 
 
 
435 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8838  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2080  isocitrate lyase  69.16 
 
 
435 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1229  isocitrate lyase  69.16 
 
 
435 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19821 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2524  isocitrate lyase  68.43 
 
 
435 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1586  isocitrate lyase  68.43 
 
 
435 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0742206  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2067  isocitrate lyase  69.4 
 
 
435 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94036  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1361  isocitrate lyase  68.43 
 
 
435 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1232  isocitrate lyase  69.16 
 
 
434 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635123  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0999  isocitrate lyase  69.5 
 
 
440 aa  625  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3224  isocitrate lyase  68.43 
 
 
475 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2613  isocitrate lyase  68.43 
 
 
435 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2088  isocitrate lyase  68.43 
 
 
475 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00747543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1998  isocitrate lyase  68.67 
 
 
435 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1295  isocitrate lyase  69.16 
 
 
434 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0485225  normal  0.330509 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6029  isocitrate lyase  69.4 
 
 
435 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2470  isocitrate lyase  68.43 
 
 
435 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2048  isocitrate lyase  69.4 
 
 
435 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0189  isocitrate lyase  70.19 
 
 
433 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0259015  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1017  isocitrate lyase  70.24 
 
 
430 aa  621  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4375  isocitrate lyase  71.87 
 
 
428 aa  619  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4164  isocitrate lyase  70.73 
 
 
428 aa  620  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.652432  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  69.32 
 
 
428 aa  618  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  69.93 
 
 
428 aa  616  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1287  isocitrate lyase  70.19 
 
 
443 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.745788  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0040  isocitrate lyase  71.84 
 
 
426 aa  612  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0028  isocitrate lyase  67.22 
 
 
427 aa  605  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4157  isocitrate lyase  67.45 
 
 
425 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0289432  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1182  isocitrate lyase  67.45 
 
 
425 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00317473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1229  isocitrate lyase  67.45 
 
 
425 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1052  isocitrate lyase  67.22 
 
 
425 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  67.22 
 
 
425 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  67.22 
 
 
425 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  67.22 
 
 
425 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1501  isocitrate lyase  70.9 
 
 
461 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1287  isocitrate lyase  66.98 
 
 
425 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000193732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1027  isocitrate lyase  66.75 
 
 
425 aa  598  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.156161  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1402  isocitrate lyase  67.94 
 
 
422 aa  601  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  66.51 
 
 
425 aa  598  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0311  isocitrate lyase  69.73 
 
 
429 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.251887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1033  isocitrate lyase  66.75 
 
 
425 aa  599  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00237406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4116  isocitrate lyase  66.06 
 
 
441 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1335  isocitrate lyase  65.89 
 
 
439 aa  594  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1748  isocitrate lyase  66.28 
 
 
441 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.191807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3687  isocitrate lyase  65.83 
 
 
441 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.978448  normal  0.141916 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3098  isocitrate lyase  66.82 
 
 
432 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183218  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3602  isocitrate lyase  65.83 
 
 
441 aa  594  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3389  isocitrate lyase  66.06 
 
 
441 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.580592 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2855  isocitrate lyase  66.36 
 
 
439 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4054  isocitrate lyase  68.37 
 
 
492 aa  591  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0308  isocitrate lyase  69.01 
 
 
429 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2860  isocitrate lyase  66.59 
 
 
439 aa  594  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  70.07 
 
 
1111 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3364  isocitrate lyase  64.91 
 
 
441 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1869  isocitrate lyase  65.19 
 
 
439 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.612764  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1506  isocitrate lyase  65.12 
 
 
432 aa  589  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3196  isocitrate lyase  64.91 
 
 
441 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0249331 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  70.56 
 
 
1110 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1276  isocitrate lyase  66.06 
 
 
450 aa  588  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  69.83 
 
 
1111 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0816  isocitrate lyase  67.55 
 
 
429 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.745785  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0698  isocitrate lyase  69.1 
 
 
435 aa  585  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2380  isocitrate lyase  66.44 
 
 
439 aa  586  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  69.55 
 
 
1111 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2101  isocitrate lyase  65.42 
 
 
439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0829587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2063  isocitrate lyase  66.43 
 
 
426 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1558  isocitrate lyase  67.07 
 
 
429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0405  isocitrate lyase  68.04 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1102  isocitrate lyase  64.16 
 
 
438 aa  579  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2942  isocitrate lyase  64.22 
 
 
440 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.337122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>