196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1296 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  51.97 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.45 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  40.78 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  42.39 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  40.36 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  40.69 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  38.49 
 
 		 283 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  42.51 
 
 		 284 aa  192  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  38.68 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  37.19 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  38.3 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.73 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  41.63 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  38.11 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  37.14 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  35.79 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  37.98 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  37.24 
 
 		 410 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  39.01 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.59 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  39.68 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  35.84 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  32.68 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  38.29 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  37.81 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  35.13 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  35.51 
 
 		 291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  37.15 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  36.61 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  37.68 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  37.46 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.64 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.4 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  37.74 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  38.82 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  37.35 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  38.43 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  38.34 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  35.89 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  34.52 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  37.6 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  36.62 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  37.94 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 296 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.99 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  38.43 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  36.5 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  35.25 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  34.7 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  35.69 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  33.57 
 
 		 276 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  31.49 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  36.5 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  32.62 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  33.1 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  31.14 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  33.69 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  32.41 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  34.59 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  33.46 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  31.49 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  31.23 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  41.24 
 
 		 212 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  32.4 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1944  helix-turn-helix domain protein  31.96 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00923208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  35.36 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  32.17 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  35.9 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  34.6 
 
 		 308 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  37.07 
 
 		 299 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  31.16 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  30.6 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1479  hypothetical protein  34.29 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0632  helix-turn-helix domain-containing protein  30.88 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  35.04 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3365  helix-turn-helix domain-containing protein  33.81 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  33.67 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  30 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  34.05 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  32.19 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  32.68 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  36.61 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1133  helix-turn-helix domain-containing protein  30.14 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.924131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  31.51 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>