13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1221 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1221  SAF domain protein  100 
 
 		 223 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1738  hypothetical protein  38.46 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00359989  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2596  SAF domain-containing protein  33.15 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.936822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4731  SAF domain-containing protein  23.26 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8600  SAF domain protein  31.25 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.418503 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  33.06 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  31.93 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1539  SAF domain-containing protein  29.27 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0772  hypothetical protein  29.05 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5833  SAF domain-containing protein  31.49 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08710  SAF domain-containing protein  46.67 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4029  SAF domain protein  29.2 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  hitchhiker  0.00623297 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  28.48 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>