More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1171 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 490 aa  923    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  39.7 
 
 		 498 aa  323  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  42.07 
 
 		 487 aa  302  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  33.61 
 
 		 478 aa  295  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  42.98 
 
 		 497 aa  290  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  39.91 
 
 		 509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  35.83 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  38.17 
 
 		 485 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  37.14 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  40.6 
 
 		 486 aa  269  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  38.43 
 
 		 498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  37.37 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  40.62 
 
 		 483 aa  264  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  44.29 
 
 		 414 aa  262  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.1 
 
 		 598 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  38.97 
 
 		 580 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  43.21 
 
 		 575 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  39.88 
 
 		 501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  37.78 
 
 		 505 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  41.63 
 
 		 573 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  37.02 
 
 		 576 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  40.22 
 
 		 499 aa  253  6e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  40.09 
 
 		 574 aa  253  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  39.74 
 
 		 580 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  38.41 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  40.22 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  40.83 
 
 		 498 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.6 
 
 		 578 aa  251  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  38.34 
 
 		 573 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  36.91 
 
 		 575 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  36.91 
 
 		 575 aa  249  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  38.78 
 
 		 572 aa  249  8e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  35.94 
 
 		 576 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  35.94 
 
 		 576 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  35.94 
 
 		 576 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  35.94 
 
 		 576 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  38.84 
 
 		 580 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  37.5 
 
 		 580 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  38.63 
 
 		 580 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  37.31 
 
 		 496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  38.63 
 
 		 580 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  38.76 
 
 		 498 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  35.17 
 
 		 445 aa  243  7e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  36.55 
 
 		 574 aa  242  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  38.63 
 
 		 580 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  31.28 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  39.52 
 
 		 530 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  37.71 
 
 		 581 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  43.16 
 
 		 490 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3821  potassium/proton antiporter  37.47 
 
 		 574 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000259426  hitchhiker  0.000169781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  40.99 
 
 		 500 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  38.03 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113521  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  38.03 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  38.03 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  38.03 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  37.22 
 
 		 577 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  37.22 
 
 		 577 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  37.22 
 
 		 577 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  37.22 
 
 		 577 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  37.81 
 
 		 578 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  37.81 
 
 		 578 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000399384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  37.81 
 
 		 578 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  36.73 
 
 		 574 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  36.73 
 
 		 574 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  37.81 
 
 		 578 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  37.81 
 
 		 578 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  37 
 
 		 577 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  42.74 
 
 		 490 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  45.97 
 
 		 598 aa  236  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1841  Na(+)/H(+) exchanger  34.53 
 
 		 485 aa  236  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  40.47 
 
 		 570 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  36.52 
 
 		 574 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  37.56 
 
 		 582 aa  233  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  35.88 
 
 		 574 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  38.13 
 
 		 593 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0086  sodium/hydrogen exchanger  43.82 
 
 		 505 aa  231  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  38.86 
 
 		 491 aa  230  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  42.31 
 
 		 490 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  38.4 
 
 		 598 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  36.46 
 
 		 572 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  37.84 
 
 		 597 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  37.37 
 
 		 596 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66380  potassium/proton antiporter  37.61 
 
 		 538 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  39.63 
 
 		 597 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  33.27 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  37.39 
 
 		 597 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2947  sodium/hydrogen exchanger  40.79 
 
 		 535 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  40.69 
 
 		 541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  37.86 
 
 		 580 aa  221  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 		 531 aa  219  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  44.9 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  37.34 
 
 		 605 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  36.66 
 
 		 626 aa  217  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  35.47 
 
 		 608 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  36.73 
 
 		 569 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  36.25 
 
 		 597 aa  213  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3197  potassium/proton antiporter  36.07 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000394197  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  36.97 
 
 		 597 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  36.6 
 
 		 588 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0927  sodium/hydrogen exchanger  44.88 
 
 		 492 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>