More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1123 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  100 
 
 		 257 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  74.1 
 
 		 252 aa  358  5e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  61.18 
 
 		 266 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  60.16 
 
 		 254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  58.4 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  59.92 
 
 		 254 aa  271  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  58 
 
 		 268 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.91 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.94 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.56 
 
 		 293 aa  262  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  57.54 
 
 		 254 aa  261  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  57.71 
 
 		 276 aa  259  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3107  ABC transporter related  59.76 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000121464  hitchhiker  0.00525293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  56.45 
 
 		 279 aa  255  5e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  56.97 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  51.79 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  51.41 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.8 
 
 		 274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  45.77 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  48.8 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  48.4 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  45.76 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  43.22 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  38.75 
 
 		 241 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  40.74 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  33.19 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  34.73 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  40.24 
 
 		 244 aa  175  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  37.92 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.45 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  33.07 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  38.14 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  39.02 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  39.02 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  36.25 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.04 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  36.21 
 
 		 250 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  36.21 
 
 		 250 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  38.62 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  38.62 
 
 		 244 aa  168  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  34.3 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  38.55 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 248 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  37.25 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  36.02 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  40.08 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  39.91 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  38.46 
 
 		 244 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  38.82 
 
 		 236 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  38.46 
 
 		 244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  38.46 
 
 		 244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  38.93 
 
 		 244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 		 241 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  38.06 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  39.84 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  38.08 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 356 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  38.87 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.94 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  35.24 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  40.65 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  39.34 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.27 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  38.46 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  32.92 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  36.44 
 
 		 315 aa  161  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 310 aa  161  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.88 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  40.42 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  36.36 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.35 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.99 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  36.25 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  41.52 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  37.1 
 
 		 310 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  36.02 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  40.49 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  39.04 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  39.5 
 
 		 247 aa  159  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  38.43 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  32.91 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  32.91 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>